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原创 转录组流程-SRA数据转化为fastq数据
此处的绝对路径可在进入fastq目录后用pwd显示出绝对路径,然后用fqdir=绝对路径。#-O 输出文件名,前面设置了{fqdir},因此生成的文件会被直接放入fastq中。#此处我不能直接调用fastq-dump,因此需要在前面加入绝对路径。在下了sratoolkit 软件后,我们首先创建一个fastq目录。#--gzip是将输出fastq文件变为gz格式,方便节省空间。#--split-3 是把文件分成两个文件输出。
2023-04-17 13:32:14 894 1
原创 conda下如何下载软件
里面的xxx为软件名,下载中途出现[y]/n选择y即可下载,成功后可以用conda list看下载是否成功。我配置了channels,但是用conda install xxx下载并不能成功。下面试了两种方法可以下载成功。
2023-04-15 17:16:23 518 1
空空如也
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