文章讲述了在安装了SRAToolkit之后，如何创建fastq目录，以及如何利用该工具进行单个文件的转换，包括使用--gzip压缩文件以节省空间，--split-3选项将文件拆分为两个部分，并将输出文件直接保存到指定的fastq目录中。
在下了sratoolkit 软件后，我们首先创建一个fastq目录
mkdir fastq
fqdir=/home/centos/fastq
#此处的绝对路径可在进入fastq目录后用pwd显示出绝对路径，然后用fqdir=绝对路径
然后先转换单个文件
/home/centos/software/sratoolkit/bin/fastq-dump --gzip --split-3 -O ${fqdir} SRRxxxx
#此处我不能直接调用fastq-dump，因此需要在前面加入绝对路径
#--gzip是将输出fastq文件变为gz格式，方便节省空间
#--split-3 是把文件分成两个文件输出
#-O 输出文件名，前面设置了｛fqdir｝，因此生成的文件会被直接放入fastq中
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