下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容。
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一、数据可视化(Data Visualization)
......
二、运用 Shiny 包打造基于鸢尾花数据集的交互式数据可视化应用
在数据科学中,数据的探索和可视化是分析的重要组成部分。R 语言提供了强大的工具来进行数据分析和可视化,其中 Shiny 包允许我们构建交互式的 Web 应用,使用户可以动态地探索数据。本文将详细介绍如何使用 Shiny 构建一个交互式的散点图应用,该应用允许用户选择鸢尾花数据集的不同变量进行可视化,并通过多种选项自定义图形。
1、准备工作
在开始之前,请确保你已经安装了以下 R 包:
shiny
: 用于构建交互式 Web 应用的核心包。bslib
: 提供主题支持,允许我们定制 Shiny 应用的外观。dplyr
: 一个用于数据操作的 R 包,使数据过滤和选择更加简洁和高效。ggplot2
: R 中最流行的数据可视化包,用于创建优美且灵活的图形。ggExtra
: 用于在ggplot2
图形上添加额外信息,如边际图。
可以通过运行以下命令来安装这些包:
install.packages(c("shiny", "bslib", "dplyr", "ggplot2", "ggExtra"))
2、鸢尾花数据集
鸢尾花数据集(iris
)是数据科学中常用的经典数据集之一。该数据集包含 150 条记录,每条记录代表一朵鸢尾花的测量数据。数据集包括四个数值变量(萼片长度、萼片宽度、花瓣长度和花瓣宽度)和一个分类变量(物种)。
3、构建 Shiny 应用
我们将分两个部分来构建这个应用:用户界面(UI)和服务器端逻辑(Server)。用户界面定义了应用的外观及交互元素,而服务器端逻辑则处理用户的输入并生成相应的输出。
加载展包和筛选数值型列
# 加载必要的R包
library(shiny) # 用于构建交互式Web应用
library(bslib) # 用于主题定制的包
library(dplyr) # 数据操作包
library(ggplot2) # 数据可视化包
library(ggExtra) # 用于在ggplot2图形中添加边际图的包
# 加载鸢尾花数据集
df <- iris
# 筛选出适合散点图的数值型列
df_num <- df |> select(where(is.numeric))
例如,如果鸢尾花数据集中包含列
Sepal.Length
、Sepal.Width
、Petal.Length
、Petal.Width
和Species
,其中前四列是数值型,那么df_num
将只包含前四列。
4、定义用户界面
在 Shiny 应用中,用户界面(UI)定义了应用的布局和用户交互组件。我们将使用 page_sidebar
函数来创建一个带有侧边栏的页面布局。
# 定义用户界面
ui <- page_sidebar(
sidebar = sidebar(
# 下拉菜单让用户选择X轴变量
varSelectInput("xvar", "X 变量", df_num, selected = "Sepal.Length"),
# 下拉菜单让用户选择Y轴变量
varSelectInput("yvar", "Y 变量", df_num, selected = "Sepal.Width"),
# 复选框组允许用户根据物种进行筛选
checkboxGroupInput(
"species", "按物种筛选",
choices = unique(df$Species),
selected = unique(df$Species)
),
hr(), # 添加水平分隔线
# 复选框允许用户选择是否按物种显示
checkboxInput("by_species", "显示物种", TRUE),
# 复选框允许用户选择是否显示边际图
checkboxInput("show_margins", "显示边际图", TRUE),
# 复选框允许用户选择是否添加平滑曲线
checkboxInput("smooth", "添加平滑曲线")
),
# 输出散点图
plotOutput("scatter")
)
varSelectInput
: 允许用户从鸢尾花数据集的数值变量中选择 X 轴和 Y 轴的变量。checkboxGroupInput
: 允许用户根据物种筛选数据。hr
: 插入一条水平分隔线,以分隔不同的输入控件。checkboxInput
: 复选框,用于控制是否显示物种、是否添加边际图,以及是否在散点图中添加平滑曲线。plotOutput
: 用于在页面上展示由ggplot2
生成的图形。
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