2301_79425796的博客

R语言的快速发展离不开其强大的开源社区。R语言的早期用户大多是学术界的统计学家和研究人员，他们不仅使用R语言进行数据分析，还积极参与到R语言的开发和扩展中来。随着R语言的普及，越来越多的贡献者开始为R语言开发新的功能、编写文档和提供技术支持。

R语言的诞生离不开S语言的影响，特别是在语法和函数结构方面。S语言的一大特点是其面向对象的编程风格，这一特点在R语言中得到了继承和发展。R语言通过函数式编程和面向对象编程的结合，提供了灵活的编程接口，允许用户自定义数据结构和分析流程。

机器学习和传统统计学是数据科学中相辅相成的两个重要分支。机器学习主要侧重于开发和使用算法来识别数据中的模式，并对未知事物进行预测和分类，它强调自动化和处理大规模数据的能力，通过训练模型从数据中进行学习，以实现高效的预测和识别任务。

在R语言中，有几个著名的机器学习扩展包，它们为数据科学家和分析师提供了强大的工具。caret是一个广泛使用的包，简化了模型训练和调参的流程，支持多种算法。randomForest包实现了随机森林算法，常用于分类和回归任务。xgboost包以其高效的梯度提升框架著称，特别适合处理大规模数据集。此外，tidymodels是一个现代化的建模框架，整合了多个包，为机器学习提供了简洁而灵活的工作流程。

计算机技术能够将这个世界上浩如烟海的数据转化为知识、事实和信息。在此，就不得不提及人工智能（Artificial Intelligence, AI）了。在人工智能中，“人工”这个词汇是英文单词“artificial”的中文译意。在日常用语里，“artificial”一词意为合成的（也就是人造的），这往往带有负面意味，意味着“人造物体仅仅是真实物体的次要形式”。

在学习过程中，循序渐进是非常重要的。过早追求高深知识可能会导致学习者陷入困境。我们的专栏设计了一条循序渐进的学习路径，从基础到高级，帮助学习者逐步提高。通过专栏的阶段性评估和反馈，学习者可以确保自己在掌握基础知识后，再进入更高级的学习领域。

R语言的一个显著优势是它的免费和开源性。与SPSS、SAS，甚至Excel等商业软件相比，R完全免费。SPSS和SAS这些统计软件虽然功能强大，但通常价格昂贵，对于学生和学者来说，获取和使用这些软件的成本可能非常高。此外，我们常用的OFFICE软件的EXCEL也能进行数据分析，但是定期支付许可费用才能继续使用。

apply()函数可以作用于矩阵和数据框的行或者列。第一个参数指定了函数应用的数据集；第二个参数必须给出将应用函数的维度，1代表行，2代表列；第三个参数是要应用的函数。

在R语言中，除了使用循环的方式来操作数据外，我们还可以使用更简洁和高效的遍历函数。这些函数可以帮助我们对数据进行各种操作，避免了显式的循环语句，使代码更加简洁和易读。以下是几种常用的遍历函数及其应用示例。

您还可以嵌套多个for循环，这意味着在另一个for循环中有一个for循环。这在处理多维数据结构（如矩阵或数据框）时非常有用。以下是使用嵌套for循环遍历矩阵并打印其元素的示例。

switch函数根据表达式的值选择并执行相应的代码块。

if-else结构用于根据条件的真假执行不同的代码块。语法如下：

在R中，一个基本的控制流构造是for循环，它允许您遍历一组对象，如向量、列表、矩阵或数据框，并在给定的数据结构中的每个项目上应用相同的操作集。另外，这个for循环有助于保持代码整洁，避免不必要的代码块重复。它们使您能够有效地执行重复任务，并可以应用于各种数据结构，使它们成为R编程的通用和必要部分。

矩阵的转置是指将矩阵的行和列互换。R语言中的t()函数用于对矩阵进行转置操作。

xor()函数用于计算两个逻辑值的异或操作。当一个参数为TRUE，另一个参数为FALSE时，结果返回TRUE，否则返回FALSE。

逐元素逻辑或运算符|用于逐一比较两个逻辑向量的元素。只要对应位置的两个元素中有一个为TRUE，结果就为TRUE。只有当两个元素都为FALSE时，结果才为FALSE。

逻辑运算在编程语言中扮演着至关重要的角色，主要用于控制程序的执行流程。R语言中的逻辑运算主要是用于判断条件是否满足，从而执行相应的代码块。逻辑运算通常返回布尔值（TRUE或FALSE），并在条件筛选和数据清洗等过程中发挥重要作用。以下将详细介绍关系逻辑、与或逻辑以及判断逻辑。

掌握这些基本的算术运算，不仅是 R 语言编程的基石，更是开展医学数据分析与建模的关键所在，进而为临床数据的科学分析提供强有力的计算支撑。以下为重要计算函数表，以助大家运用：

整除运算用于计算两个整数相除的商和余数。在医学数据处理中，整除运算可以帮助我们理解数据的分布情况或进行数据分组。

在R语言中，赋值运算不仅可以对单个变量赋值，还可以通过链式赋值对多个变量同时赋值。这种功能非常便利，可以在一行代码中对多个变量进行初始化或赋值。

R语言中，列表是一种非常灵活的数据结构，它可以存储不同类型的对象，如向量、矩阵、数据框、甚至其他列表。与数据框不同，列表中的元素可以是各种类型和长度的对象。这使得列表成为处理复杂数据和非结构化数据的强大工具。创建列表的基本函数是list()。

dplyr是R语言中的一个非常流行的数据操作包，它提供了简单且直观的语法来进行数据操作。dplyr主要用于数据帧（data frame）的操作，包括过滤行、选择列、重新排序、添加新列、以及汇总数据等。其中，as_tibble()函数可以将矩阵转换为数据框，并显示更多信息（记得要先自行安装dplyr扩展包）。

数组（Array）是一种重要的数据结构。它与矩阵有一定的相似性，都只能包含同一类型的数据。然而，数组有一个显著的特点，那就是其维度可以大于 2，这一点与矩阵不同。在 R 语言里，数组通过array()函数来创建。

矩阵是一种二维数组，每个矩阵仅能包含一类数据（数值型、字符型或者逻辑型）。可以通过函数 matrix() 来构建矩阵。其中，nrow 和 ncol 参数分别用于指定行和列的维数；dimnames 参数包含了可供选择的、以字符型向量形式呈现的行名和列名；byrow 参数表示矩阵应当按行填充（TRUE）还是按列填充（FALSE），默认是按列填充。另外，list() 函数用于创建列表。

因子型向量（Factor vector）是将数据存储为整数值向量的一种分类变量（Categorical variables）。它可分为无序分类变量（Unordered categorical variable）和有序分类变量（Categorical variable）两类。其中，在因子变量中所包含的非重复值被称作因子水平。函数 factor() 是以整数向量的形式来存储类别值，其取值范围是[1…k]（这里的 k 是名义型变量中唯一值的个数），同时一个由字符串（原始值）构成的内部向量会映射到这些整数上。

数值型变量，又称定量变量（Quantitative variables），是指通过定量方法测定的，具有数值大小（高低或多少）的指标。根据其取值的连续性，数值型变量可以分为连续型变量（Continuous variables）和离散型变量（Discrete variables）。

变量（Variable）是储存数据的抽象概念，主要为了让数据存放到计算机内存的某个空间位置。可以将变量比作不同大小的“容器”，每个容器可以容纳特定类型和数量的数据元素（或元值、元数据）。这些“容器”有大有小，有的适合装数字，有的适合装字符，还有的可以装更复杂的数据结构，就像我们日常生活中用来装不同物品的箱子、瓶子和袋子一样。

临床公共数据库是指由政府机构、学术机构、医院或其他组织收集并公开发布的临床数据集合。这些数据库通常包含了大量的患者信息、医疗记录、实验数据等，供研究者免费下载或付费使用。临床公共数据库的出现具有以下几方面的意义。

大家要注意，在使用网络爬虫时，必须遵守相关法律法规和网站的使用条款。一些网站明确禁止爬虫行为，或者要求用户获得许可后才能进行数据抓取。未经授权的大规模爬取可能会对目标网站造成负担，甚至导致法律纠纷。因此，在进行网络爬虫时，应该尊重网站的robots.txt文件，该文件规定了网站允许和禁止爬取的部分。

​我们还可以对数据集按Sepal.Length列进行降序排序，并获取前 3 行数据：输出结果表明iris数据集中，Sepal.Length最大的前三个观测值均属于virginica物种。

iris数据集是由 Ronald A. Fisher 在 1936 年引入的经典数据集，广泛用于机器学习和数据分析教学。它包含 150 个观测值，每个观测值代表一朵鸢尾花的测量结果，包括花萼长度、花萼宽度、花瓣长度、花瓣宽度四个变量，以及鸢尾花的种类（setosa、versicolor、virginica）。该数据集因其简单性和多样性，常用于演示分类和聚类算法。iris数据集通过不同种类花朵的测量特征，展示了数据在多维空间中的分布，有助于理解和应用统计方法和机器学习模型。

SQL（Structured Query Language）是一种标准化的编程语言，用于管理和操作关系型数据库。构建SQL数据库在数据存储、管理和检索方面提供了许多显著的优势。

R Markdown允许用户灵活地控制图形的外观。通过设置图形的尺寸和其他属性，可以确保图形在报告中的显示效果符合要求。具体的设置可以通过以下参数实现：fig.width和fig.height: 这两个参数用于指定生成图形的宽度和高度，单位是英寸。例如，fig.width=10表示图形的宽度为10英寸，fig.height=5则表示图形的高度为5英寸。

“From Template”栏目代表着可对不同写作模板进行选择。如果你需要使用特定的写作模板，可以选择From Template栏目。这些模板可以帮助你快速创建格式化良好的报告。例如，你可以选择CteX中文套装模板来创建中文报告，并输出为PDF格式。

R Markdown是 R 语言环境中提供的 markdown编辑工具，运用 R Markdown撰写文章，既可以像一般的 markdown编辑器一样编辑文本，也可以在 RMarkdown 中插入代码块，并将代码运行结果输出在 markdown里。R Markdown 格式，简称为 Rmd 格式， 相应的源文件扩展名为 .Rmd。输出格式可以是 HTML、docx、pdf、beamer 等。

一种方法是先将其他统计软件中的数据导出为文本文件，如CSV或TXT格式，然后再使用R的read.table()或read.csv()函数将数据读入R中。这种方法虽然简单，但可能会遇到数据格式不一致、编码出错等问题。也可以使用其它的R扩展包。

openxlsx包是R中用于读取、写入和格式化Excel文件的工具。与其他Excel处理包相比，openxlsx包不依赖于Java，操作更为简洁高效，支持多种Excel格式的读写。在使用openxlsx包之前，需要首先安装并加载该包。可以通过以下命令安装并加载openxlsx。

TXT格式是微软操作系统上附带的一种常见文本格式，早在DOS时代就已被广泛应用。尽管建议使用read.csv()和write.csv()函数处理此类文件，但read.table()和write.table()函数也能完成相关的读取和保存操作，感兴趣的读者可以自行尝试。

在这段代码中，readRDS()函数用于从名为data_list.rds的RDS文件中读取数据，并将其赋值给变量data_list_rds。这个函数专门用于读取RDS格式的文件，能够恢复保存的单个R对象。随后，print()函数被用来显示从RDS文件中读取的数据，以便用户检查和验证数据的内容。通过这些函数，用户可以方便地加载和查看之前保存的数据。

使用Addins功能：在RStudio的菜单栏中，点击“Addins”按钮，选择“Paste as data.frame”选项。这时，数据将自动粘贴为data.frame格式并显示在RStudio的控制台中，如下图。