常用数据库的 API - 开篇

本文介绍了API的基本概念,并以REST API为例进行了说明。接着,重点讲述了常用的数据库API,如NCBI和EMBL-EBI,以及如何利用这些API查询和获取基因信息。以Ensembl的RESTful API为例,展示了在Unix、Python、Java、Perl和R中查询基因信息的方法,强调了API在批量处理和高效数据交互中的优势。
摘要由CSDN通过智能技术生成

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API

API 这个词在大多数人看来可能和 CNS 差不多,前者天天听说就是用不上,后者天天读就是发不了。

不过,通过今天的一个简短介绍,今后 API 这个东西你就用上了,因为在文章最后我将会展示一个最最基础且高频的 API 使用示例。

所谓 API(Application Programming Interface) 就是应用程序接口。这个应用程序可以类比于手机和电脑,这个接口就类似于数据线,如果我们想用数据线把东西在两个设备之前传输,就需要两者可以接受彼此的传输协议。如我们在电子商务中,经常就会用到的电商API即商品详情关键字搜索等封装了商品详情介绍,主图,商品价格,商品SKU数据等API数据接口,以获取商品信息。

对一个应用程序来说,如果你想快速的和它交换数据,也需要采用应用程序可以识别的规则。对于一些成熟的应用程序和网站来说,通常都会提供自己的一套API供开发者友好的使用,一方面可以大大扩展应用程序的生态环境,另一方面也可以避免暴力的爬虫。

我们通过下图的「印象笔记 API」为例,如果你使用过印象笔记(Evernote)的话,会发现大量第三方应用都可以支持绑定印象笔记账户进行各种创建笔记推送笔记等操作。这里不是印象笔记去适配第三方应用,而是它提供了一个完善的 API,可以供其他开发者来使用。

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REST API

API 之后还有一个概念是 REST API。 REST(Representational State Transfer

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