BrainNet Viewer使用教程（包括安装教程）

藤井树－

于 2025-01-18 14:17:54 发布

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文章标签： matlab

本文链接：https://blog.csdn.net/2302_78340288/article/details/145223503

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前言

BrainNet Viewer是由由北京师范大学开发的一个应用于Matlab的工具包，主要用于脑网络的可视化，可以帮助研究人员以快速、简单和灵活的方式从不同层次可视化结构和功能连接模式。

一、下载安装

工具包网址：NITRC：BrainNet 查看器：工具/资源信息

网页显示如下：

在绿色的"Execution Options"中的"Download Now"中选择符合自己电脑系统的压缩文件（.zip）下载。

解压之前下载的文件至MATLAB的安装目录下（"\Matlab 2023a\BrainNetViewer_20191031"）

打开MATLAB,点击"环境"中的"设置路径"

点击"添加并包含子文件夹"

选择之前复制在MATLAB文件夹下的解压包并确定。

当MATLAB搜索路径中出现下面这些路径时即添加成功。

最后点击保存，则安装成功。

二、使用

在命令行窗口中输入"BrainNet Viewer"

出现下面界面说明启动成功

点击"File->Load File"，出现下面页面，共有四个文件可供选择Surface file（表层文件）、Data file（node）（节点文件）、Data file（edge）（边文件）、Mapping file（映射文件）

选择相应文件

Surface文件在包内已经有基本模型文件，也能自己进行模型构建。

node文件和edge文件需要自行进行创建。

在加载文件后会出现设置窗口

选择自己需要的视图

进行全局设置的调整

针对surface，node，edge文件都有其单独的设置，来使图片/模型能更具象化、精细化的表达，输出的image文件也能进行设置。

下面将对node，edge文件的创建和模型的具象化、精细化表达进行介绍。

三、node文件的创建

首先明确所需要构建模型的EEG电极类型，并通过下表来进行位置坐标的查询。

根据上表来进行node文件的创建

每个节点都有6列，前三列为节点坐标（即上方表查询可得），第四列代表节点颜色，第五列代表节点大小，第六列代表节点名称，下面以一个具体的文件举例。

首先创建一个（.txt）文本文件-->按照上方规则输入-->保存文件-->修改后缀为.node

获得电极位置置入BrainNet Viewer如下图所示。

四、edge文件的创建

所谓edge文件便是两个节点间连线的参数。所以很容易想到两两之间的关系可以使用N阶矩阵表示（N为节点的数量）。只要在每一行每一列输入节点连线的数值就可获得edge文件（例如下图）。

当然对于单个脑部的EEG信号只会出现0、1二值，对于多个EEG信号可以进行平均化处理，则可能会出现小数值，依然可以在edge文件中出现。

一般EEG信号会通过.csv文件或者.xls文件存储，平均化处理非常的麻烦。所以我做了一个MATLAB程序，可以直接输出平均矩阵，可粘贴到.txt文件中，修改后缀后可获得.edge文件。

% 设置文件夹路径
folderPath = ' '; % 替换为你的文件夹路径

% 获取所有CSV文件
fileList = dir(fullfile(folderPath, '*.csv'));

% 初始化一个变量用于存储总和
totalSum = [];

% 记录文件数量
fileCount = length(fileList);

% 遍历每个文件
for i = 1:fileCount
    % 获取当前文件的完整路径
    filePath = fullfile(folderPath, fileList(i).name);
    
    % 读取CSV文件并转换为矩阵
    currentMatrix = csvread(filePath);
    
    % 累加当前矩阵
    if isempty(totalSum)
        totalSum = currentMatrix; % 如果是第一次，初始化总和
    else
        totalSum = totalSum + currentMatrix; % 否则进行累加
    end
end

% 计算均值
if fileCount > 0
    averageMatrix = totalSum / fileCount; % 除以文件数量
else
    averageMatrix = []; % 如果没有文件，则均值为空
end

% 输出均值矩阵
disp('所有CSV文件的矩阵均值为:');
disp(averageMatrix);