一、BrainNet Viewer简介
效果图:
BrainNet Viewer是一个用于人脑连接的网络可视化工具。需要导入四种类型的导入文件brain surface、node、edge和volume文件。
- brain surface脑表面文件。brain surface文件是一个以’ nv '为后缀的ASCII文本文件,包含四个字段:顶点的数量、每个顶点的坐标、三角形面的数量和组成三角形的顶点的索引。
使用FreeSurfer (http://surfer.nmr mgh.harvard.edu/)生成的半球网格.pial 文件和使用BrainVISA (http://brainvisa.info/)生成的mesh文件也支持直接加载。 - node节点文件。节点文件是一个“node”后缀的ASCII文本文件。
节点信息在节点文件中排列为6列:
1-3列分别表示节点的x、y、z坐标;
第4列表示节点颜色的索引;
第5列表示节点大小;
列6表示节点标签。第6列中的’- '符号表示对应节点没有标签。
这个文件的值很容易根据显示的网络的各个方面进行安排。例如,节点的模块信息可以分配到第4列,用颜色区分节点属于不同模块。第5列可设为节点度、中心性和t值,以强调根据大小不同的节点差异。 - edge边文件。brain edge文件是一个以’ edge '为后缀的ASCII文本文件,表示节点之间的一个关联矩阵(例如相关性),可以进行加权或二值化,因此&#