文献学习|DBB2 调节玉米株高和避阴反应

摘要

在过去几十年中，增加种植密度被认为是提高玉米产量的有效策略。然而，密植显著降低了冠层内的光照强度和红光与远红光（R:FR）光比，从而触发了遮荫避光反应（SAR），这限制了在高密度条件下进一步提高产量的可能性。

在本研究中，我们鉴定了一种含有双B盒结构域的蛋白DBB2，它是ZmBBX家族的成员，能够被遮荫快速诱导，且是调控玉米株高和遮荫避光反应的关键因子。DBB2基因的破坏导致玉米节间变短、株高降低、细胞伸长减少以及对遮荫的敏感性降低，而这些效应可以通过外源施用赤霉素（GA）得到显著缓解。此外，我们发现DBB2能够与转录因子HY5发生物理互作，抑制其对编码赤霉素失活酶GA2氧化酶的基因ZmGA2ox4的转录激活。这种互作通过赤霉素途径正向调控玉米株高。此外，我们还发现遮荫诱导ZmDBB2的表达是由转录因子PIF4介导的。有趣的是，DBB2随后与PIF4互作，增强细胞伸长相关基因（如ZmEXPA1）的转录激活，从而在冠层遮荫条件下建立了一个促进细胞伸长的正反馈回路。我们的研究结果强调了BBX蛋白在调控玉米株高和遮荫避光反应中的关键作用，并将其作为开发适合密植条件的玉米品种的关键遗传靶点。本研究还为理解遮荫避光反应的分子机制提供了新的见解，并为玉米株型和产量的遗传改良提供了潜在策略。

引言

玉米（Zea mays）是种植范围最广且消费量最大的主粮作物，在全球粮食安全中发挥着至关重要的作用。在过去几十年中，通过增加具有理想（或“智能”）株型的杂交品种的种植密度，玉米产量得到了显著提高。在玉米生产中，理想的株高和果穗位置对于最大化产量和最小化倒伏风险至关重要。较矮的植株和较低的果穗位置通常更不易发生倒伏，而倒伏是指在收获前茎秆折断或弯曲，会对产量造成严重影响（Lima等，2006；Zhang等，2006）。降低植株和果穗的高度使玉米更加健壮，能够更好地抵御恶劣天气条件，并便于机械化收割（Wang等，2020）。因此，精准调控植株和果穗高度对于玉米育种中提高产量稳定性和种植效率的努力至关重要。

作物的株高受到茎秆中节间数量和长度的共同影响（Le等，2022）。在20世纪中期的“绿色革命”中，水稻和小麦株高的降低在显著提高全球粮食产量方面发挥了关键作用，主要是通过增强抗倒伏能力实现的。尽管它们的分子机制有所不同，但小麦中的Rht-1（Reduced height-1，编码DELLA蛋白）和水稻中的SD1（Semi-dwarf1，编码GA20-氧化酶2）都通过调节赤霉素（GA）途径来调控株高。在玉米中，许多与赤霉素途径相关的基因已被鉴定为株高的关键调控因子。其中，ZmDWARF1（ZmD1）和GAD5（也称为D3基因）分别编码与赤霉素生物合成相关的酶，即GA3氧化酶和内贝壳杉烯酸氧化酶（KAO），它们的破坏会导致矮化（Winkler，1995；Nelissen等，2012；Teng等，2013）。此外，编码DELLA蛋白的ZmD8和ZmD9基因，其突变也会导致矮化（Lawit等，2010）。

除了赤霉素，生长素也在调控株高中发挥着至关重要的作用。ZmBrachytic2（ZmBr2）基因编码生长素转运载体蛋白ABCB1；其突变会阻断生长素的极性运输，抑制节间伸长，从而降低株高（Multani，2003；Xing等，2015；Wei等，2018；Zhao等，2023）。Terminal ear1（ZmTE1）影响节间的细胞伸长，其突变会显著降低株高（Veit等，1998；Wang等，2021）。此外，油菜素内酯生物合成基因的突变，例如ZmBRD1（Brassinosteroid-deficient dwarf1）（Makarevitch等，2012；Tian等，2019）、ZmDWARF4（Liu等，2020；Tian等，2024）和ZmDET2（也称为Nana Plant1，NA1）（Hartwig等，2011），也会导致矮化和多种发育缺陷。

尽管许多与株高相关的基因已被鉴定，但它们的突变往往会导致过度矮化和其他不良影响，因此不适合直接应用于作物生产。因此，全面了解株高的调控机制对于实现理想的株高和最大化粮食产量至关重要。

株高受到外部环境信号的显著影响，尤其是光照和温度，而这两者又都受到种植密度的强烈影响（Jafari等，2024）。在低密度种植条件下，或者在没有冠层遮荫的生长早期阶段，玉米植株周围被高强度的光照和有利的高红光与远红光比（R:FR）所包围。相比之下，高密度种植改变了冠层内的光照环境，导致光照强度降低和R:FR比值降低。这些光照信号的变化随后触发了一系列形态和生理反应，这些反应统称为遮荫避光反应（SAR），包括株高增加、叶夹角变小、雄穗早熟、雄穗分支减少以及茎秆变细等性状。这些性状在高密度种植场景中可能是有害的，可能会限制产量的增加，或者在恶劣天气条件下导致产量损失（Cao等，2022；Kong等，2023）。因此，理解SAR的调控机制并找到减轻其不利影响的方法，是提高玉米耐密性和最大化产量的关键策略（Wang等，2016）。

在模式植物拟南芥（Arabidopsis thaliana）中，多种光受体，如光敏色素（phyA、phyB）、隐花色素（CRY1）和UVR8，已被鉴定为与SAR相关的各种细胞过程的关键参与者（Keller等，2011；Keuskamp等，2011；Sharma等，2019）。此外，许多光信号转导组分，包括光敏色素相互作用因子（PIF4、PIF5、PIF7）（Lorrain等，2008；Quail，2012；Huang等，2018；Burko等，2022）、B盒蛋白（BBX21、BBX22、BBX24）（Crocco等，2010，2015）以及同源框蛋白（HB、HB2、HB4）（Sorin等，2009），都参与了SAR的调控。在玉米中，研究表明，ZmphyB1和ZmphyB2的破坏会导致中胚轴和茎的细胞快速伸长、叶夹角变小、茎秆变细以及雄穗早熟（Sheehan等，2007）。此外，玉米中的phyA、phyC和CRY1b已被证明在调控玉米株高和遮荫反应中发挥关键作用（Li等，2020b；Cao等，2023；Chen等，2024）。相反，ZmPIF3s、ZmPIF4s或ZmPIF5s的破坏会导致中胚轴伸长和株高降低，以及对模拟遮荫的敏感性降低（Wu等，2019）。此外，破坏ZmHB53（一种II类同源域亮氨酸拉链（HD-ZIP II）转录因子）已被证明可以降低中胚轴和株高，同时增加对低R:FR模拟遮荫和密度诱导的冠层遮荫的抗性（Shi等，2024）。在拟南芥中，bZIP转录因子HY5是光信号和光形态建成的核心调控因子，通过抑制下胚轴细胞伸长发挥作用（Li等，2020a）。先前的研究还表明，HY5与其他蛋白（如BBX20、BBX21和BBX22）相互作用，调控多种目标基因的表达（Bursch等，2020）。这些发现强调了光信号组分在调控株高和SAR中的关键作用，突出了外部环境信号与内部遗传途径在玉米中的复杂相互作用。理解这些相互作用可以为开发在不同种植密度和光照条件下改善玉米生长的策略提供见解。

在植物中，B盒（BBX）家族蛋白可以根据其N端区域的B盒结构域数量以及C端区域是否存在CCT结构域被分为五个亚家族（Gangappa和Botto，2014；Xu等，2023）。I组主要由具有两个B盒结构域和一个CCT结构域的BBX蛋白组成，而II组和III组包含具有一个B盒结构域和一个CCT结构域的BBX蛋白，它们在VP区域有所不同。IV组和V组仅包含缺乏CCT结构域的BBX蛋白（Xu等，2023）。值得注意的是，在拟南芥和玉米中分别鉴定出32个和36个BBX蛋白（Gangappa和Botto，2014；Xu等，2023）。在拟南芥中，包括BBX1/CO、BBX21和BBX25在内的几种BBX家族蛋白已被证明在光形态建成、遮荫避光反应（SAR）和开花时间中发挥核心作用（Onouchi等，2000）。在玉米中，研究主要集中在BBX家族蛋白，如COL3、CCT9和CCT10，这些蛋白对于调控开花时间和影响不同玉米自交系或品种的地理分布至关重要（Huang等，2017；Jin等，2018；Li等，2022）。此外，在番茄中，SIBBX31被鉴定为一个关键的转录因子，参与对低温的响应和适应（Zhu等，2023）。尽管取得了这些进展，但BBX家族蛋白在玉米株型和遮荫反应中的调控作用仍鲜为人知。进一步研究这些蛋白可能为它们在植物发育和适应不同环境条件中的贡献提供宝贵的见解，尤其是在与种植密度和光照可用性相关方面。

在我们之前的研究中，我们发现多种BBX家族基因的转录能够被短期模拟遮荫处理快速诱导，这表明它们可能在玉米的遮荫避光反应中发挥作用（Shi等，2019）。在本研究中，我们专注于ZmDBB2（双B盒锌指蛋白2）及其密切相关同源物ZmDBB12（双B盒锌指蛋白12）的生理和分子功能。我们的研究结果表明，ZmDBB2（而非DBB12）的突变导致株高降低和对模拟遮荫处理的敏感性降低。我们证明了DBB2与HY5相互作用，抑制了参与赤霉素代谢的基因ZmGA2ox4的表达，从而正向调控玉米株高。此外，我们观察到在遮荫条件下，PIF4能够快速诱导ZmDBB2的转录。值得注意的是，DBB2与PIF4相互作用，协同促进与细胞伸长相关的基因（如ZmEXPA1）的表达，从而正向调控遮荫反应。我们的研究不仅阐明了DBB2在调控株高中的生理功能，还突出了控制植物适应不利光照条件的复杂遗传相互作用。