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+ [3.设置nnUNet读取文件的路径](#3nnUNet_53)
一、写在前面
重要!!!
各位读者有时间请务必到我第十七篇博客查看更多的细节,包括如何使用nnUNet的残差网络、如何选择模型其中一个去训练等。更多的细节会慢慢更新,建议直接把那篇收藏了。
1.更新于8.02,添加“如何训练自己的数据集”部分。
2.更新于9.07,修改恶心的apex部分,新更新的torch1.6支持混合精度训练,即你不用再安装apex啦!!!
3.更新于9.09,修改五折交叉验证理解!以及在整理好训练的数据集以后如何自动化地生成对应的json文件。
3.更新于11.05,添加如何在Windows上使用nnUNet。windows的使用仍然面临很多问题,预处理是可以跑的,但是在推理或者训练的时候就会出现torch的一些环境和兼容问题,现在仍未解决,也不是目前的工作重心,有时间有能力的读者可以自己挖掘一下,非常的不好意思。
4.更新于21.04.20,解决windows平台无法使用nnUNet问题。
- 1.笔者对nnUNet的使用也才一个多月,真正进入医疗影像领域也才三个月。对于nnUNet的理解肯定还停留在表层,希望大家在使用的时候能抱着一种纠错的态度,我会很感谢大家的指点!
- 2.nnUNet是德国癌症研究中心的工程师编写的框架,迄今为止依旧在维护和更新,希望大家共勉,“抄”出自己的水平的同时,协助框架的维护,也是在帮助中国医疗行业(手动狗头)。
- 3.此框架仅在Ubuntu18.04上进行过安装,win上需要键入参数运行,框架作者的建议也是在linux系统。作者建议不在conda的环境下,但我的框架在两个服务器三台主机上都未遇到什么conda的问题。1.5.1+cu10.1
网上学习资料一大堆,但如果学到的知识不成体系,遇到问题时只是浅尝辄止,不再深入研究,那么很难做到真正的技术提升。
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