PEAKS是由加拿大BSI公司开发的基于bottom up技术路线的蛋白质组学质谱数据的一站式软件分析平台。其中行业标准的蛋白质从头测序de novo算法,广泛应用于蛋白质组学、抗体药物的研究。
PEAKS Studio 12 能够完整地进行从数据转化到蛋白鉴定及定量,翻译后修饰及序列突变,最终进行结果验证、可视化以及报告的分析流程。
软件功能特色:
1、基于特征的鉴定工作流程,可提高灵敏度并最大限度地提高肽鉴定效率。
专为 DDA 技术设计,可提高可重复性。
集成数据库搜索和从头测序,以扩展深入分析。
在PEAKS DDA工作流程中激活深度学习提升,以最大限度地提高肽鉴定效率。
2、通过直接数据库搜索 DIA 简化工作流程
DIA 分析是 DDA 工作流程的一种有吸引力的替代方案。过去,DIA方法依赖于从DDA生成谱库来鉴定和定量肽。PEAKS Studio 11 提供独特的 DIA 工作流程,通过集成三种方法(谱库搜索、直接数据库搜索和从头测序)最大限度地提高肽的鉴定率。
针对预定义的谱库执行谱库搜索。没有谱库匹配的肽谱图可以直接在蛋白质数据库中搜索。
使用DIA数据直接搜索蛋白质序列数据库。先进的机器学习算法可以提高肽鉴定的准确性和灵敏度。在管道的这一步中,PEAKS 11 DIA 工作流程现在支持识别用户指定的任何 PTM。这将能够提高修饰肽的鉴定,而无需将其输入谱库。
数据库搜索中不匹配的谱图是从头测序的。
从谱库搜索和蛋白质序列数据库搜索中鉴定出的肽可用于定量分析。
注意:所有 3 种检索方法、PEAKS 谱库检索、直接数据库检索和从头测序都是可选的,工作流程的步骤可以独立进行,也可以按顺序进行。
3、PEAKS DeepNovo 肽组学:免疫肽组学高级解决方案
这种新开发的解决方案是肽组学数据的专用工作流程,结合了数据库搜索、从头测序和突变肽鉴定。
4、离子淌度可实现定量,以最大限度地减少缺失值并提高准确性
5、PEAKS糖基模块插件使科学家能够确定糖基位点定位和糖基结构
PEAKS糖模块是一个全面的数据分析工具,它提供了一个高度灵敏和准确的糖蛋白组学软件解决方案,以促进我们对糖蛋白组的理解。了解更多信息
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