POJ 2778 DNA SequenceAC自动机 矩阵快速幂

#include <iostream>
#include <string.h>
#include <stdio.h>
#include <algorithm>
#include <queue>
#include <math.h>
#define mod 100000
#define LL long long

using namespace std;
const int M = 4;
const int N = 1e6+10;
struct Matrix{
    int mat[110][110];
    int n;
    Matrix(){}
    Matrix(int nn){
        n = nn;
        for(int i = 0; i < n; ++i){
            for(int j = 0; j < n; ++j){
                mat[i][j] = 0;
            }
        }
    }
    Matrix operator * (const Matrix& b)const{
        Matrix ret = Matrix(n);
        for(int i = 0; i < n; ++i){
            for(int j = 0; j < n; ++j){
                for(int k = 0; k < n; ++k){
                    int tmp = (LL)mat[i][k]*b.mat[k][j]%mod;
                    ret.mat[i][j]=(ret.mat[i][j]+tmp)%mod;
                }
            }
        }
        return ret;
    }
};
struct Trie{
    int next[N][M],fail[N];
    bool end[N];
    int root,L;
    int getIndex(char ch){
        switch(ch){
        case 'A':
            return 0;
        case 'C':
            return 1;
        case 'G':
            return 2;
        case 'T':
            return 3;
        }
    }
    int newNode(){
        for(int i = 0; i < M; ++i){
            next[L][i] = -1;
        }
        end[L++] = false;
        return L-1;
    }
    void init(){
        L = 0;
        root = newNode();
    }
    void insert(char buf[]){
        int now = root;
        for(int i = 0 ; buf[i]; ++i){
            int x = getIndex(buf[i]);
            if(next[now][x] == -1){
                next[now][x] = newNode();
            }
            now = next[now][x];
        }
        end[now] = true;
    }
    void build(){
        queue<int>Q;
        for(int i = 0; i < M; ++i){
            if(next[root][i] == -1){
                next[root][i] = root;
            }
            else{
                fail[next[root][i]] = root;
                Q.push(next[root][i]);
            }
        }
        while(!Q.empty()){
            int now = Q.front();
            Q.pop();
            if(end[fail[now]] == true)
                end[now] = true;
            for(int i = 0; i < M; ++i){
                if(next[now][i] == -1){
                    next[now][i] = next[fail[now]][i];
                }
                else{
                    fail[next[now][i]] = next[fail[now]][i];
                    Q.push(next[now][i]);
                }
            }
        }
    }
    //计算的是选择0个、1个、、、n个的总数目
//    Matrix getMatrix(){
//        Matrix res = Matrix(1+L);
//        for(int i = 0; i < L; ++i){
//            for(int j = 0; j < M; ++j)
//                if(end[next[i][j]] == false)
//                    res.mat[i][next[i][j]]++;
//        }
//        for(int i = 0; i < L+1; ++i){
//            res.mat[i][L] = 1;
//        }
//        return res;
//    }
    //计算选择n个的数目
    Matrix getMatrix(){  
        Matrix res = Matrix(L);  
        for(int i = 0; i < L; ++i){  
            for(int j = 0; j < M; ++j)  
                if(end[next[i][j]] == false)  
                    res.mat[i][next[i][j]]++;  
        }  
        return res;  
    }  
};
Trie ac;
char buf[20];
Matrix pow_Matrix(Matrix a,int n){
    Matrix ret = Matrix(a.n);
    for(int i = 0; i < ret.n; ++i)
        ret.mat[i][i] = 1;
    while(n){
        if(n&1){
            ret = ret*a;
        }
        a = a*a;
        n >>= 1;
    }
    return ret;
}
int main()
{
    int n,m;
    while(~scanf("%d%d",&n,&m)){
        ac.init();
        for(int i = 0; i < n; ++i){
            scanf("%s",buf);
            ac.insert(buf);
        }
        ac.build();
        Matrix a = ac.getMatrix();
        a = pow_Matrix(a,m);
        int ans = 0;
        for(int i = 0; i < a.n; ++i){
            ans =(ans+a.mat[0][i])%mod;
        }
        printf("%d\n",ans);
    }
    return 0;
}

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以下是Java解决POJ3233—矩阵幂序列问题的代码和解释: ```java import java.util.Scanner; public class Main { static int n, k, m; static int[][] A, E; public static void main(String[] args) { Scanner sc = new Scanner(System.in); n = sc.nextInt(); k = sc.nextInt(); m = sc.nextInt(); A = new int[n][n]; E = new int[n][n]; for (int i = 0; i < n; i++) { for (int j = 0; j < n; j++) { A[i][j] = sc.nextInt() % m; E[i][j] = (i == j) ? 1 : 0; } } int[][] res = matrixPow(A, k); int[][] ans = matrixAdd(res, E); printMatrix(ans); } // 矩阵乘法 public static int[][] matrixMul(int[][] a, int[][] b) { int[][] c = new int[n][n]; for (int i = 0; i < n; i++) { for (int j = 0; j < n; j++) { for (int k = 0; k < n; k++) { c[i][j] = (c[i][j] + a[i][k] * b[k][j]) % m; } } } return c; } // 矩阵快速幂 public static int[][] matrixPow(int[][] a, int b) { int[][] res = E; while (b > 0) { if ((b & 1) == 1) { res = matrixMul(res, a); } a = matrixMul(a, a); b >>= 1; } return res; } // 矩阵加法 public static int[][] matrixAdd(int[][] a, int[][] b) { int[][] c = new int[n][n]; for (int i = 0; i < n; i++) { for (int j = 0; j < n; j++) { c[i][j] = (a[i][j] + b[i][j]) % m; } } return c; } // 输出矩阵 public static void printMatrix(int[][] a) { for (int i = 0; i < n; i++) { for (int j = 0; j < n; j++) { System.out.print(a[i][j] + " "); } System.out.println(); } } } ``` 解释: 1. 首先读入输入的n、k、m和矩阵A,同时初始化单位矩阵E。 2. 然后调用matrixPow函数求出A的k次幂矩阵res。 3. 最后将res和E相加得到结果ans,并输出。 4. matrixMul函数实现矩阵乘法,matrixPow函数实现矩阵快速幂,matrixAdd函数实现矩阵加法,printMatrix函数实现输出矩阵。
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