OCT病灶分割论文泛读

作者:Jathurong Sugruk, Supaporn Kiattisin and Adisorn Lee1asantitham
来源:The 2014 Biomedical Engineering International Conference
摘要:提出了一种基于图像分割和二分类的方法对AMD和DME的OCT图像进行分类。分类的过程中涉及到病灶的定位和病灶特征的提取。实验过程中,10张AMD和6张DME的图像,分类准确率为87.5%。

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病灶位置确定

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2.Automated drusen segmentation and quantification in SD-OCT images

作者:Qiang Chen,Department of Radiology, Stanford University
来源:Medical Image Analysis 2013
摘要:提出了一种自动分割玻璃膜疣的方法,同时结合正常视网膜的形态和结构特征作为分割的先验信息。同时为了更准确地分割玻璃膜疣的边界,采用了将三维OCT图像投影得到眼底图像的方法。
本文提出方法流程图:

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图(a)为ILM的分割结果,图(b)为通过阈值分割获得的结果。

上图(a)中,白色区域为RPE层,红线为每一列RPE层次的中点,绿线为红线的三次多项式拟合,用来表示正常视网膜下的RPE层中点线。红线高于绿线的区域即为玻璃膜疣的位置。
数据:143只眼睛的体数据,其中99只为干性AMD患者。采集设备为CirrusHD-OCT 4000 device (Carl Zeiss Meditec, Inc., Dublin, CA),每个体数据包含128张512*1024的图像。
分割结果

上图中蓝色和黄色为两个专家标定的结果,红色为本文算法分割的结果

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作者:M. Usman Akram, Sundus Mujtaba*, Anam Tariq
来源:2013 IEEE
摘要:本文提出了一种自动分割彩色眼地图中AMD病灶区域的方法。该方法首先定位可能的AMD区域,之后在这些区域中提出特征,使用SVM判断其是否属于AMD。

本文方法流程图

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滤波器组为Gabor Filter Banks。
数据:STARE数据库,400张700*605的图像,其中有58张AMD患者的图像。
分割结果

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作者:LUIS DE SISTERNES
来源:2017 BOE
摘要:本文提出了一种自动分割AMD患者视网膜OCT黄斑图像的方法。该方法采用基于加权中值滤波的迭代边界分割算法获得视网膜的10条边界线。实验结果表明,针对健康图像和AMD患者图像的分割准确率分别为98.15%和97.78%。

10条边界线示意图

流程图
数据:114个健康人眼和255个AMD患者人眼数据。
分割结果
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MUE:mean unsigned positioning error


作者:S. P. K. KARRI
来源:2017 BOE
摘要:本文通过Fine-turning在ImagNet上预训练的GoogleNet来识别视网膜中的病变部位。该算法的目标在于表明在非医学图像上训练的CNN能够经过Fine-turns用于医学图像的处理。本文中处理对象为AMD和DME患者的OCT图像。
数据:15个AMD、15个DME和15个正常人的体数据,来自杜克大学的实验室。每个类型中选出8个体数据作为训练集。
实验结果

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未来的工作会将这些不同的响应合并成一个响应图像,以便更好地表示病灶区域


6.Machine learning based detection of agerelated macular degeneration (AMD) and diabetic macular edema (DME) from optical coherence tomography (OCT) images

作者:YU WANG Chinese Academy of Sciences(中国科学院)
来源:2016 BOE
摘要:本文提出了一种基于机器学习的方法对AMD、DME和正常人的OCT图像进行分类。分类中所使用的特征基于LCP和空间金字塔,同时使用Correlation-based Feature Subset(CFS)对特征进行选择,最后使用sequential minimal optimization(SMO,序列最小优化算法)进行分类,获得了99.3%的准确率。
算法流程图如下:

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数据:来自杜克大学的VIP实验室。数据包含15个AMD、15个DME和15个正常人的体数据。
实验分析

不同特征使用SMO的分类准确率

相同特征下不同分类器的准确率

与其它文章对比


作者:Freerk G. Venhuizen
来源:2017 IOVS
摘要:本文实现了一种基于机器学习的AMD患病程度的自动分级系统。该系统可以在不对层次进行分割的情况下将AMD患者的OCT图像分为5个不同的阶段:无AMD、早期AMD、中期AMD、晚期AMD+青光眼、晚期AMD+CNV。
不同阶段AMD患者图像示例:

 (a) No AMD, (b) early AMD

 (c) intermediate AMD, (d) advanced AMD with GA

(e) advanced AMD with CNV
方法流程图

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数据
来自1016个患者的3265个体数据,数据来源于European Genetic Database
实验结果

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作者:Pratul P. Srinivasan Duke University
来源:2014BOE
摘要:本文提出了一种基于HOG算子和SVM的OCT图像分类方法,将患者图像分为AMD、DME和正常三个类别,三个类别的分类准确率为100%、100%、86.67%。
流程图

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数据:来自杜克大学的正常、AMD和DME患者体数据各15个。
实验结果

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