好物推荐：眼科影像研究组有哪些？

前言

对于一个研究者而言，应该时刻关注该领域的动向，例如所研究的领域有哪些最新的文章、有哪些比较大的研究组、有哪些大牛研究者。紧跟领域前沿不仅能够帮助我们在研究中不落后，也能够帮助我们了解更多别人在做的idea同时调整自己的idea。

这里对领域内较大的眼科影像方面的研究组做个汇总整理，希望能够对大家有所帮助。

排名不分先后，越靠前的不代表实力越强

1. Vision and Image Processing (VIP) Laboratory

该实验室隶属于杜克大学(Duke)，其在该领域非常有名且发表了众多眼科影像相关的论文。我在研究生阶段刚开始看的论文就是来自这个实验室。其主要的研究方向为：

• Medical Image Analysis Software Development
• Image Processing Theory and Application
• Advanced Ophthalmic Imaging Hardware Development

除了论文以外，该实验室更重要的工作来自于公开数据集的贡献。很多数据集的公开都是在当时业内为独一份，很大地促进了该领域的发展。举2个经典的数据集：

• World’s largest annotated SD-OCT dataset for intermediate AMD and control subjects used in our recent paper (目前仍是世界最大)
• Dataset for OCT cyst and layer segmentation and Analysis in DME eyes (做糖尿病型黄斑水肿DME分割绕不开的一个数据集)

除了数据集以外，也有一些公开的用于眼科影像分析的软件，有兴趣的同学可以去看一看。

2. Pattern Recognition Lab

该研究组属于Friedrich-Alexander-Universität大学，其专注于影像和语音方面的模式识别，研究领域较为广泛，其中就包括了眼科影像分析。官方介绍如下：

In the recent decade, ophthalmic imaging has proven to be a steadily growing field of research. A milestone in ophthalmology was the transfer of Optical Coherence Tomography (OCT) from research to clinical use. Compared to conventional fundus photography, OCT allows the three dimensional, depth resolved visualization of the human retina, while preserving the non-invasiveness. Recently, a radical change occured in the field of OCT research with the clinical introduction of OCT angiography (OCTA), which further adds dye-free imaging of the underlying vasculature.

目前的研究集中在2个方面：

• 对OCTA影像进行运动补偿、阴影补偿以及信号重建以得到更加高质量的影像
• 对视网膜中的层次和病灶区域进行准确分割和分析

在第2项的工作，该研究组开发了领域内较早的自动对视网膜OCT图像进行层次分割的软件OCTSeg，详解介绍可见之前的文章。

3. Biomedical Optical Imaging and Biophotonics Group

该实验室隶属于麻省理工(Massachusetts Institute of Technology)，同时其成员也是光学相关断层成像技术(OCT)的发明者，在OCT影像领域来说可以说是巨佬了。其研究领域不局限于眼科OCT分析，也有将OCT技术应用到其它身体部位的，如下图所示。

4. The Iowa Institute for Biomedical Imaging (IIBI)

该研究组隶属于University of Iowa，其mission是在生物医学成像领域促进高效、合作的跨学科和跨学院的研究和发现。该机构研究领域涉及较为广泛，主要集中在眼科和脑科的影像处理，这里主要介绍其在眼科影像分析方面的工作。

对眼科影像的分析主要涉及眼科中各种常见的疾病在影像上的表现，如diabetic retinopathy, macular degeneration, macular holes, epiretinal membranes, macular edema, central serous choroidopathy, and of the optic disc, 同时结合OCT影像对其进行分割和分析。主要可以分为以下几个方面：

• 眼底图分析 Fundus image analysis：
  • 眼底图中的视网膜异常 Retinal abnormalities from fundus images
  • 眼底图中的血管分析 Vasculature analysis from fundus images
  • 部分商业化实践
• 视网膜OCT图像分析 Retinal OCT image analysis
  • 年龄型黄斑变性(AMD)的影像分析和预测
  • 基于OCT的青光眼筛查
• 通用的OCT影像分析工具 Iowa Reference Algorithms
  • OCT Explorer：OCT影像可视化和标注工具
  • OCTSegmenter：视网膜OCT影像分割工具，能够在以黄斑中心的图像分割出7个层次之间的边界

  上述工具的介绍可以看之前的文章。

5. BIOSIMA

BIOSIMA(BioMedical Image and Signal Analysis)在2013年建立，隶属于Department of Computer Engineering, NUST College of EME, Rawalpindi, Pakistan。其主要研究在于生物医学影像处理和计算机辅助系统。目前实验室主页介绍的有关眼科影像的项目主要有：

• OCT image analysis system for grading and diagnosis of retinal diseases and its integration in i-Hospital
• Detection of glaucoma using structural and non-structural features
• Decision Support System for Detection of Glaucoma using Structural and Non Structural Features

该实验室虽然建立的比较晚，但也发了不少论文已经公开了一些数据集。有需要的同学可以去主页看看。

不过遗憾的是，在数据集下载页面上出现了Bug，导致没办法申请数据集的下载。也发过邮件询问过，但没有回复。

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