MRI和CT扫描这样的诊断程序会创建体数据,它由一维和二维图像来表示通过三维物体的截面。体绘制是一种计算机图形技术,利用这种类型的体数据来构造三维图像。体绘制常用于分析医学扫描,也可用于地质、考古和分子生物等学科,生成三维科学可视化效果。
参考书籍《Python极客项目编程》。这里只是列出源代码及其运行效果,程序设计及运行的原理请参阅上述书籍。
运行环境
操作系统Win11。
Python 3.10.5。
电脑连接互联网。
安装相关包
需要的包有PyOpenGL、GLFW、numpy、matplotlib、scipy等。
PyOpenGL、GLFW的安装可参考网页 今日头条 。
其他几个包的安装可在命令行窗口用如下命令:
pip install numpy
pip install matplotlib
pip install scipy
源代码
源代码网址: pp/volrender at master · electronut/pp · GitHub
pp/common at master · electronut/pp · GitHub
斯坦福体数据下载网址: The Stanford volume data archive
下载后得到压缩文件“mrbrain-8bit.tar.gz”,解压到目录“mrbrain-8bit”中。
将上述网页中的文件都下载保存到目录“D:\temp\MyPython\volrender”中。
目录“mrbrain-8bit”中是若干图片:
运行结果
启动命令行窗口执行命令 “python D:\temp\MyPython\simplegl\simpleglfw.py”,运行结果如下:
set PATH=%PATH%;D:\Softwares\GLFW\glfw-3.3.8.bin.WIN64\lib-vc2022\
cd D:\temp\MyPython\mrbrain-8bit
D:
python volrender.py --dir mrbrain-8bit/
上述第一条命令的作用是,在cmd窗口中临时设置系统环境变量PATH的值(使用setx可以永久更改PATH的值)。
程序运行时,按V键在三维和二维之间切换,X、Y、Z键分别表示绕相应的轴旋转。