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原创 CADD药物设计专题干货总结
在新型冠状病毒的治疗方案中，通过同源建模方法发布了新冠病毒的三维结构，通过药物靶标预测、筛选出针对新型冠状病毒的药物，通过一系列计算机辅助药物生物计算的方法发现一大类药物分子可以有效阻止新冠病毒的侵染，为治疗新冠提供了新机理和新思路。 课程名称 课程内容 生物分子互作基础 1.生物分子互作用研究方法 1.1蛋白-小分子、蛋白-蛋白相互作用原理 1.2 分子对接研究生物分子相互作用 1.3 蛋白蛋白对接研究分子相
2021-07-16 17:02:20
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原创 amber分子动力学模拟干货总结
AMBER软件安装运行、模型构建及力场文件生成、能量优化、溶剂模型、MM/PBSA方法结合自由能计算、另配合专业案例及经典文章案例复现 分子动力学入门理论 教学目标：了解本方向内容、理论基础、研究意义。 分子力学简介 分子力学的基本假设 分子力学的主要形式 分子力场 分子力场的简介 分子力场的原理 分子力场的分类及应用 分子动力学 分子动力学流程 AM
2021-07-16 17:14:24
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原创 药学薛定谔专题干货总结
使用薛定谔软件进行分子对接、虚拟筛选，基于药效团的虚拟筛选、构效关系预测分子活性等专业技术 蛋白-配体相互作用 分子对接基础、原理及对接软件介绍 分子对接软件（薛定谔) 使用 2.1半柔性对接 2.1.1 小分子配体优化准备 2.1.2 蛋白受体优化及坐标文件准备 2.1.3 蛋白受体格点计算 2.1.4 半柔性对接计算 2.2对接结果评价...
2021-07-16 17:08:53
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原创 先导化合物筛选专题干货总结
第一天上午 新药先导筛选新策略 运用组合筛选全新方法发现新药先导化合物 1.1基于药效团的虚拟筛选方法 1.2 基于分子对接的虚拟筛选方法 1.3组合筛选的基本原理 1.4组合筛选全新方法-用于先导化合物的快速发现 数据库构建和类药性筛选 数据库的构建和类药性筛选 2.1 分子结构及小分子数据库的构建 2.2 多肽数据库的构建 2.3 类...
2021-07-16 17:03:41
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原创 COMSOL 专题学习
COMSOL软件入门仿真框架建立及软件基本操作1、初识COMSOL仿真以多个具体的案例建立COMSOL仿真框架，熟悉软件的使用方法；2、COMSOL软件基本操作2.1 参数及变量设置方法2.2 几何建模2.3基本函数设置方法，如插值函数、解析函数、分段函数等2.4特殊函数的设置方法，如积分、求极值、求平均值等2.5网格划分3、前处理和后处理的技巧讲解3.1特殊变量的定义，如散射截面等3.2如何利用软件的绘图功能绘制不同类型的数据图3.3数据导出3.4不同类型求解.
2021-06-30 16:27:18
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原创 COMSOL 专题学习
COMSOL软件入门仿真框架建立及软件基本操作1、初识COMSOL仿真以多个具体的案例建立COMSOL仿真框架，熟悉软件的使用方法；2、COMSOL软件基本操作2.1 参数及变量设置方法2.2 几何建模2.3基本函数设置方法，如插值函数、解析函数、分段函数等2.4特殊函数的设置方法，如积分、求极值、求平均值等2.5网格划分3、前处理和后处理的技巧讲解3.1特殊变量的定义，如散射截面等3.2如何利用软件的绘图功能绘制不同类型的数据图3.3数据导出3.4不同类型求解.
2021-06-21 10:04:03
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原创 人工智能药物设计技术与应用实践
人工智能药物设计技术与应用实践 课程名称 课程内容 分子表征及特征提取 1. 分子描述符和分子指纹 1.1 分子描述符和分子指纹概念 1.2 分子描述符类别和特点 1.3 分子指纹的类别和特点 2. 分子描述符/指纹计算软件 2.1 分子表示方法和格式...
2021-06-03 14:33:17
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原创 代谢组学数据分析及网络药理学研究技术与实践
一、代谢组学研究技术与实践 1、代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨 1.1 代谢组学概述 1.2 代谢组学操作流程 1.3 样本的采集、储存与制备关键问题 2、代谢组学数据采集与预处理，决定数据统计结果的准确性 2.1 常用技术平台介绍（NMR和LC-MS） 2.2 常用软件和数据库介绍（代谢物鉴定、数据预处理与分析） 2.3 数据预处理，包括数据归一化、标准化和数据转化以及缺失值评估等 3、基...
2021-06-03 14:12:02
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空空如也
空空如也
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