不能联网的服务器上安装R包

之前需要在服务器上安装Y叔的clusterProfiler，但是，由于服务器不能连外网，颇费了几番周折去安这个R包…

1.windows下R包安装的简便操作

if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE))
    install.packages("BiocManager")

BiocManager::install("clusterProfiler")

2.不能联网的服务器上的安装

R CMD INSTALL /.../my_package.tar.gz  --library=/my/lib/path

具体步骤为：

1. 先下载想要安装的R包
   -如果目标R包在CRAN中可以下载到的话，则直接下载my_package.tar.gz即可
   -如果目标R包不在CRAN，而是在github或其它地址，很可能下载下来的是my_package.zip文件，那么我们在上传到服务器之后，需要先进行unzip my_package.zip，然后再转换为tar.gz格式tar -zcv -f my_package.tar.gz my_package
2. 通过R CMD INSTALL /.../my_package.tar.gz --library=/my/lib/path进行安装

不过通常一个R包背后都会是一堆堆的的依赖包，所以做好为了安装一个R包需要安装很长一段时间的心理准备吧！