常用命令行的一些小知识点

有时候遇到要从git 里面clone github的情况，打开git真是不知所措，因为命令行一点也不会，现在简单记录一下常用的命令行：

No	命令	功能	实例
1	mkdir	创建目录	mkdir do , mkdir do/align , mkdir -p blast/hba/209
2	rmdir	删除目录	rmdir temp
3	cd	改变目录	Cd , cd do , cd .. , cd ../do/tree/7hba
4	ls	显示文件信息	ls , ls -l , ls *.fasta , ls /tmp/seq* ,ls -lR
5	cat	编辑文件	cat seq1 , cat > seq1 , cat >> seq1
6	less	显示文件内容	more myseq
7	cp	复制文件	cp seq1 seq2 , cp ../seq/hba_human.sw . , cp /tmp/seq1 . , cp *.fasta ../keep/
8	mv	更改文件名	mv seq1 seq2
9	rm	删除文件	rm seq2 , rm *.txt , rm tem/seq.* , rm -rf tmp
10	chmod	改变权限	chmod -w seq1.fasta , chmod +w *.needle , chmod 755 *

命令1 ： mkdir
用途： 创建目录
实例1： mkdir do
含义：在当前目录下创建名为do的子目录
实例2： mkdir do/align
含义： 在子目录do下创建名为 align 的子目录（子目录do已经存在）
实例3： mkdir -p hba/tree
含义：在当前目录下创建名为hba的子目录，并在子目录hba下创建名为tree的子目录

命令2：rmdir
用途： 删除目录
实例1： rmdir tmp
含义： 删除当前目录下名为tmp的子目录，该子目录中没有问价你和子目录

命令3：cd
用途： 改变目录
实例1： cd
含义： 回到用户主目录，即登录时进入的目录
实例2： cd do
含义： 进入子目录do
实例3： cd ..
含义： 回到上级目录
实例4： cd hba/tree
含义： 直接进入子目录hba下的tree子目录
实例5： cd ../do/align
含义： 进入上级目录do下的align子目录

命令4：ls
用途： 显示文件或目录
实例1： ls
含义： 显示当前目录下的子目录和文件名
实例2： ls -l
含义： 显示当前目录子目录和文件名详细信息，包括属性，权限，大小和创建日期等
实例3： ls *.fasta
含义： 显示当前目录下所有以.fasta结尾的文件名
实例4： ls hba/hba_*
含义： 显示子目录hba下所有以hba_起始的文件
实例5： ls /tmp
含义： 显示/tmp目录所有子目录和文件
实例6： ls -lR
含义： 逐级显示当前目录和子目录下所有子目录和文件

命令5：cat
用途： 显示或编辑文本文件
实例1： cat > cat1
含义： 往cat1中逐行输入文本，用Ctrl - D结束输入
实例2： cat >> cat1
含义： 往cat1中逐行追加文本，用Ctrl - D结束输入
实例3： cat cat1
含义： 显示文本文件cat1中的内容

命令6： less
用途： 显示文件内容
实例1： less 209hba.list
含义： 逐屏显示文件 209hba.list内容，回车进一行，空格进一页，q终止显示

命令7：cp
用途： 复制文件
实例1： cp seq1 seq2
含义： 把文件seq1复制到文件seq2，保留seq1
实例2： cp *.fasta ../keep/
含义： 将所有文件名以.fasta结尾的文件复制到上级目录的keep子目录中
实例3： cp ../seq/hba_human.sw .
含义： 将上级目录的seq子目录中名为hba_human.sw的文件复制到当前目录中
实例4： cp /tmp/tf/zmtf-pep.fasta blast/
含义： 将/tmp目录做个tf子目录中名为zmtf-pep.fasta的文件复制到当前目录中名为blast的子目录中

命令8：mv
用途： 更改文件名
实例1： mv seq1 seq2
含义： 将文件seq1改名为seq2，不保留seq1
实例2： mv hba_human.fasta pku08s1/hba
含义： 将当前目录下文件hba_human.fasta移到子目录pku08s1下的子目录hba中

命令9： rm
用途： 删除文件或目录
实例1： rm seq2
含义： 删除文件seq2
实例2： rm *.txt
含义： 删除所有以.txt结尾的文件
实例3： rm -r temp/*
含义： 删除子目录temp下所有的子目录和文件，保留该目录
实例4： rm -r temp
含义： 删除子目录temp和该目录下所有的子目录和文件

命令10：chmod
用途： 改变文件或目录权限
实例1： chmod -w ppf1.fas
含义： 取消所有用户对ppf1.fas的写权限
实例2： chmod +w seq1
含义： 将当前目录下seq1设置为本用户可写，其他用户权限不变
实例3： chmod -w keep/
含义： 取消子目录keep的写权限，不能再该目录下创建和删除文件或子目录
实例4： chmod 755 bin/*
含义： 将子目录bin下所有文件设置为本用户可读可写可执行，其他用户可执行