【评测】Tecan品牌系列产品

Tecan简介

瑞士Tecan是全球领先的生命科学与生物制药、法医和临床诊断领域自动化及解决方案供应商。公司成立于1980年,总部设在瑞士Männedorf,分别在瑞士、北美和奥地利设有自己的研发和生产基地,目前公司主要经营的产品有三大类:全自动化液体处理平台(Liquid Handling & Robotics)、多功能酶标仪(Multimode Reader)和OEM组件;销售服务网络遍布世界52个国家,客户覆盖制药企业、生物技术公司、科研院所、法医、医院、血站系统、出入境检验检疫(CIQ)及疾病控制中心(CDC)等。其液体处理技术已拥有行业经验32年,在全球处于领先地位,备受世界领先生命科学实验室的青睐。作为原始设备OEM制造商,Tecan同样在OEM设备和组件开发和生产方面占有世界领先地位。瑞士Tecan于2004年在北京开设代表处,正式进驻中国市场。2008年4月在上海浦东成立帝肯(上海)贸易有限公司, 作为Tecan集团在亚太地区(日本及韩国除外)总部,全面负责Tecan集团在中国的所有商业活动,包括销售、市场活动与合作、以及客户支持。帝肯(上海)目前拥有一支专业的售前和售后服务团队,在科研、制药、公安刑侦、医院、血站、CDC和CIQ领域构建了良好的经销和售后服务网络,并以“力求比客户期望做的更好”的服务理念,给广大的终端用户提供专业的服务。

 

Tecan产品系列

1. 多功能成像酶标仪用于低紫外区的DNA、RNA 定量及纯度分析(A260/A280)和蛋白定量(A280/BCA/Braflod/Lowery),酶活、酶动力学检测,酶联免疫测定

(ELISAs),细胞增殖与毒性分析,细胞凋亡检测(MTT),报告基因检测及G 蛋白偶联受体分析(GPCR)之外,还有自动活细胞成像、细胞计数和汇合等功能。如果是长时间的检测细胞或者厌氧微生物,那么为细胞或者微生物配置一个更接近体内的环境是必须的。

2. TECAN 自动化工作站系统具有快速的液位检测,液体可用性检查和优先的非接触式分配。从而提高生产效率,简化操作流程,增强流程安全性简化性,为实验室带来更多可能。如果是针对细胞或者厌氧微生物的一个全自动操作系统,那么为细胞或者微生物配置一个更接近体内的环境是必须的。

3. 细胞在生物体内所需正常的生理氧环境如下:

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4. 低氧/厌氧环境系统能给全自动工作站系统提供一个模拟体内环境:

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整合SPARK 的厌氧箱

 

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面板材料:由丙烯酸板制造,保湿保温性好

配有半导体除湿降温系统

探头一键校准:保证测量准确性。

数据记录:带有USB数据记录系统

快速恢复:开门后快速恢复培养环境

全自动控制:软件连接电脑智能软件控制内部环境

氧气实时监测:配备氧气探头可以实时监测和控制厌氧度

分阶段控制进气:高氧时进氮气,低氧时进混合气,节省气体

配备高效钯催化剂剂:能快速使氢气和残量氧气反应达到厌氧

搭配内部气体循环系统:保证内部气体均一性,保障我们的厌氧效果

同时整合Tecan SPARK®酶标仪:量身定制,极大节约实验室空间

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整合全自动工作站系统的低氧/厌氧箱

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气体环境实时监测

分阶段控制进气

低氧、厌氧双模式选择

配备高效钯催化剂

面板材料:由丙烯酸板制造,保湿保温性好。

面板拆卸:便于清洁及转移实验仪器。

转移匣:转移样品和实验材料时不影响内部环境。

精确控制氧气:控制范围:0%-23%,调节精度 0.1%。

四段气体循环:用于不同浓度氧气的对比实验。

探头一键校准:保证测量准确性。

降温除湿方式:采用半导体降温除湿的方法,降温效果好。

裸手操作系统:带有袖套的裸手进入系统,操作便捷。

内置培养单元:可搭配恒温培养箱用于细胞培养。

 

应用实例

细胞低氧环境模拟系统GC应用——肠易激综合征

文章题目:Gut Microbiota in Patients With Irritable Bowel Syndrome—a Systematic Revie 综述肠易激综合征患者肠道菌群的系统综述

文章出处:Gastroenterology 2019;157:97–108 doi:10.1053/j.gastro. 2019.03.049

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肠易激综合征(irritable bowel syndrome, IBS)是一种功能紊乱性肠病, 以腹痛或腹部不适伴排便习惯改变为主要特征, 患病率达10%-20%,但很难治疗。篇综述表明1、IBS患者粪便微生物群的多样性要么减少了,要么没有改变。2、IBS患者中可能存在的有害微生物,包括变形杆菌门、肠杆菌科、乳酸菌科和拟杆菌属,其下级分类单元中又有诸多致病菌。3、IBS患者中潜在的“保护性”菌群最一致的发现是不可培养的梭菌目I ,其机制尚不清楚;另外粪杆菌属尤其是该属的普氏粪杆菌,一直与维持肠道粘膜健康有关,起到减轻IBS症状,并维持肠道屏障的完整性的作用。无论IBS亚型如何,IBS患者双歧杆菌属均明显减少,它是另一个有望改善IBS症状的属。4、因与获得粘膜相关菌群相比收集方便,几乎所有的研究都采用粪便取样,但是否存在研究差异目前尚不清楚。5、病例与对照应更匹配。如描述性别和/或年龄特征,以及未来的研究应描述以前使用过的任何抗生素和/或益生菌,及其类型、使用时间等详细信息,并记录饮食摄入量。

 

细胞低氧环境模拟系统GC应用——干细胞

文章题目:Quiescence Preconditioned Human Multipotent Stromal Cells Adapt a Metabolic Profile Favorable for Enhanced Survival Under Ischemia静止预处理下的人类多能基质干细胞有利于缺血下增强生存的代谢

文章出处:Stem Cells Doi:10.1002/stem.2493;0.1% O2, 5% CO2

主要内容:研究者发现,hMSCs在体内真实实环境更接近于于缺氧(0.1%O2)而不是体外的低氧环境(1%-5% O2)。

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在这种缺氧的环境下,hMSCs无法适应在没有外源葡萄糖存在的情况下,只能控制很有限的内部葡萄糖储备和基本为零的ATP储量。在这种外源葡萄糖水平极低的情况下,因为缺乏下调能量翻转的机制导致hMSCs能量储量的快速耗尽,直接导致其极低的存活率。

 

细胞低氧环境模拟系统GC应用——心肌细胞凋亡

 

文章题目:Up-regulation of miR-138 inhibits hypoxia-induced cardiomyocyte apoptosis via down-regulating lipocalin-2 expression

过表达 miR-138通过下调 Lcn-2 的表达抑制缺氧诱导的心肌细胞凋亡

文章出处:Exp Biol Med (Maywood). 2016 Jan, 241(1): 25-30.

工作站及气体使用情况:Ruskinn Invivo2 400 低氧:1% O2 ,5%CO2,94%N2,常氧:21% O2

主要内容:缺氧诱导的心肌细胞凋亡显着促进许多心脏疾病的发展,通过抑制细胞凋亡来促进细胞存活是减轻由心肌功能障碍引起的心肌细胞丢失的有效策略之一。过表达 miR-138通过下调促凋亡基因Lcn2的表达来抑制缺氧诱导的心肌细胞凋亡。

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在 1%氧浓度下缺氧诱导 24 小时后, 小鼠 HL-1 细胞中 miR-138 的表达显著降低,表明心肌细胞中的 miR-138 被低氧调节。而过表达 miR-138 显著促进 HL-1细胞的增殖,且显著降低了缺氧诱导的细胞凋亡, 特别是早期细胞凋亡。

 

细胞低氧环境模拟系统GC应用——肿瘤机制

 

文章题目:Different Adaptive Responses to Hypoxia in Normal and Multiple MyelomaEndothelial Cells

正常内皮细胞和多发性骨髓瘤内皮细胞在缺氧环境下的不同适应性反应

文章出处:Cell Physiol Biochem;DOI:10.1159/000488423

主要内容:在长期低氧暴露后,正常内皮细胞(EC)如人脐静脉内皮细胞(HUVEC)受到低氧损伤影响,存活率降低;而来自多发性骨髓瘤(MM)的内皮细胞则对缺氧诱导完全未受影响。

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检测DOX、DOX-LPs和缺氧响应型的DOX-HRLPs在常氧(20%O2)和低氧(1%O2)条件下孵育48h后对(A)FaDu(小鼠前列腺癌细胞系)和(B)RM-1(人咽部鳞状癌细胞系)细胞的作用:

1、DOX和DOX-LPS在不同DOX浓度下对细胞表现出相似的细胞毒性,而在缺氧条件下DOXHR-LPs比游离DOX具有更高的细胞毒性。

2、DOX-LPs和DOX在指定的低氧(10%、5%和1%O2)条件下与常氧(20%O2)条件下对FaDu细胞的细胞毒性没有差异,反之,DOX-HR-LPS的细胞毒性随氧浓度的降低而增加(C)。

 

细胞低氧环境模拟系统GC应用——NK细胞

 

文章题目:Hypoxia Induced Impairment of NK Cell Cytotoxicity against Multiple Myeloma Can Be Overcome by IL-2 Activation of the NK Cells

NK细胞IL-2活化可克服缺氧性NK细胞对多发性骨髓瘤的杀伤作用

文章出处:PLOS ONE. 2013;10.1371/journal.pone.0064835

主要内容:缺氧是大多数肿瘤组织的特征,可以改变不同免疫细胞的功能,研究发现缺氧可消除NK细胞对多发性骨髓瘤的杀伤作用,故为了设计基于NK细胞的免疫治疗,也有必要研究NK细胞与肿瘤细胞在低氧条件下的相互作用。

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将NK细胞、MM细胞或两者都预先孵育在21%或0%的O2中,并将它们组合在21%或0% O2中进行细胞毒性评估:

1、相同氧气条件下孵育的NK细胞,在0% O2条件下进行细胞毒试验(第2、4、6和8组),与在21% O2(第1、3、5和7组)中进行细胞毒试验相比,均显示NK细胞的细胞毒性降低。

2、图中第3组和第5组对比可知,在0% O2中预孵育的NK细胞不影响其杀伤活性。

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1 目标检测的定义 目标检测(Object Detection)的任务是找出图像中所有感兴趣的目标(物体),确定它们的类别和位置,是计算机视觉领域的核心问题之一。由于各类物体有不同的外观、形状和姿态,加上成像时光照、遮挡等因素的干扰,目标检测一直是计算机视觉领域最具有挑战性的问题。 目标检测任务可分为两个关键的子任务,目标定位和目标分类。首先检测图像中目标的位置(目标定位),然后给出每个目标的具体类别(目标分类)。输出结果是一个边界框(称为Bounding-box,一般形式为(x1,y1,x2,y2),表示框的左上角坐标和右下角坐标),一个置信度分数(Confidence Score),表示边界框中是否包含检测对象的概率和各个类别的概率(首先得到类别概率,经过Softmax可得到类别标签)。 1.1 Two stage方法 目前主流的基于深度学习的目标检测算法主要分为两类:Two stage和One stage。Two stage方法将目标检测过程分为两个阶段。第一个阶段是 Region Proposal 生成阶段,主要用于生成潜在的目标候选框(Bounding-box proposals)。这个阶段通常使用卷积神经网络(CNN)从输入图像中提取特征,然后通过一些技巧(如选择性搜索)来生成候选框。第二个阶段是分类和位置精修阶段,将第一个阶段生成的候选框输入到另一个 CNN 中进行分类,并根据分类结果对候选框的位置进行微调。Two stage 方法的优点是准确度较高,缺点是速度相对较慢。 常见Tow stage目标检测算法有:R-CNN系列、SPPNet等。 1.2 One stage方法 One stage方法直接利用模型提取特征值,并利用这些特征值进行目标的分类和定位,不需要生成Region Proposal。这种方法的优点是速度快,因为省略了Region Proposal生成的过程。One stage方法的缺点是准确度相对较低,因为它没有对潜在的目标进行预先筛选。 常见的One stage目标检测算法有:YOLO系列、SSD系列和RetinaNet等。 2 常见名词解释 2.1 NMS(Non-Maximum Suppression) 目标检测模型一般会给出目标的多个预测边界框,对成百上千的预测边界框都进行调整肯定是不可行的,需要对这些结果先进行一个大体的挑选。NMS称为非极大值抑制,作用是从众多预测边界框中挑选出最具代表性的结果,这样可以加快算法效率,其主要流程如下: 设定一个置信度分数阈值,将置信度分数小于阈值的直接过滤掉 将剩下框的置信度分数从大到小排序,选中值最大的框 遍历其余的框,如果和当前框的重叠面积(IOU)大于设定的阈值(一般为0.7),就将框删除(超过设定阈值,认为两个框的里面的物体属于同一个类别) 从未处理的框中继续选一个置信度分数最大的,重复上述过程,直至所有框处理完毕 2.2 IoU(Intersection over Union) 定义了两个边界框的重叠度,当预测边界框和真实边界框差异很小时,或重叠度很大时,表示模型产生的预测边界框很准确。边界框A、B的IOU计算公式为: 2.3 mAP(mean Average Precision) mAP即均值平均精度,是评估目标检测模型效果的最重要指标,这个值介于0到1之间,且越大越好。mAP是AP(Average Precision)的平均值,那么首先需要了解AP的概念。想要了解AP的概念,还要首先了解目标检测中Precision和Recall的概念。 首先我们设置置信度阈值(Confidence Threshold)和IoU阈值(一般设置为0.5,也会衡量0.75以及0.9的mAP值): 当一个预测边界框被认为是True Positive(TP)时,需要同时满足下面三个条件: Confidence Score > Confidence Threshold 预测类别匹配真实值(Ground truth)的类别 预测边界框的IoU大于设定的IoU阈值 不满足条件2或条件3,则认为是False Positive(FP)。当对应同一个真值有多个预测结果时,只有最高置信度分数的预测结果被认为是True Positive,其余被认为是False Positive。 Precision和Recall的概念如下图所示: Precision表示TP与预测边界框数量的比值 Recall表示TP与真实边界框数量的比值 改变不同的置信度阈值,可以获得多组Precision和Recall,Recall放X轴,Precision放Y轴,可以画出一个Precision-Recall曲线,简称P-R
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