小Hi和小Ho正在进行一项基因工程实验。他们要修改一段长度为N的DNA序列,使得这段DNA上最前面的K个碱基组成的序列与最后面的K个碱基组成的序列完全一致。
例如对于序列”ATCGATAC”和K=2,可以通过将第二个碱基修改为”C”使得最前面2个碱基与最后面两个碱基都为”AC”。当然还存在其他修改方法,例如将最后一个碱基改为”T”,或者直接将最前面两个和最后面两个碱基都修改为”GG”。
小Hi和小Ho希望知道在所有方法中,修改碱基最少的方法需要修改多少个碱基。
Input
第一行包含一个整数T(1 <= T <= 10),代表测试数据的数量。
每组测试数据包含2行,第一行是一个由”ATCG”4个大写字母组成的长度为N(1 <= N <= 1000)的字符串。第二行是一个整数K(1 <= K <= N)。
Output
对于每组数据输出最少需要修改的碱基数量。
Sample Input
2
ATCGATAC
2
ATACGTCT
6
Sample Output
1
3
思路
由于(1 <= K <= N)所以单纯的去对应改值显然是不对的。
那换一种思路,将所给字符串分段来做怎样?
例如:
ATACGTCT
6
时,将其想成两个。
ATACGTCT
ATACGTCT
然后将重叠部分与非重叠部分分开。
AT ACGT CT
AT ACGT CT
后以最前面那一段的长度(即字符串的长度减去k)
将字符串分段
AT AC GT CT
A B C D
AT AC GT CT
a b c d
则此时,要让b段与A段相同,即与a段相同。
则在改变b段的同时,B段也要改变,而c段又要与B段相同。
以此类推,则得到a,b,c,d四段要相同。
即求让a,b,c,d四段相同所需的最小改动值。
代码
#include<cstdio>
#include<cstring>
#include<algorithm>
using namespace std;
const int MAXN=1005;
int K,l,k,a[10],o,ans;
char c[MAXN];
int main()
{
scanf("%d",&K);
while(--K>=0)
{
for(int i=0;i<=l;i++)
c[i]=0;
ans=l=o=k=0;
scanf("%s %d",c,&k);
l=strlen(c);o=l-k;
/*if(k<(l+1)/2)
{
for(int i=0;i<k;i++)
if(c[i]!=c[i+l-k])
ans++;
printf("%d\n",ans);
continue;
}*/
for(int j=0;j<o;j++)
{
int you=0;
for(int i=0;i*o+j<l;i++)
{
you++;
switch(c[i*o+j])
{
case 'A':a[1]++;break;
case 'T':a[2]++;break;
case 'C':a[3]++;break;
case 'G':a[4]++;break;
}
}
ans+=you-*max_element(a+1,a+4+1);
a[1]=a[2]=a[3]=a[4]=0;
}
printf("%d\n",ans);
}
}