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RSS订阅原创 scanpy小技巧：利用Scanpy绘制violin图时遇到图像扁平的情况怎么处理
在利用scanpy进行单细胞测序数据分析时常常需要绘制violin图可视化一些我们需要的信息，比如。那么怎么解决这一问题呢？很简单，改变Y轴取值范围就好了。可以看到，total_counts和pct_counts_mt图显示不是很好。是不是变化挺大呀，效果更加有利于接下来我们进行过滤和其他处理！接下来我们看看改动后的效果。计数矩阵中表达的基因数量。线粒体基因计数的百分比。
2023-09-20 12:03:46
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转载 VCF格式解析
声明：本文为转载文章，如有侵权，请联系，速删！VCF是用于描述SNP，INDEL和SV结果的文件，下面所记录的是以GATK软件结果的VCF文件，与SAMtools的结果有点不同VCF文件可以分为两部分看，最上面#号注释的的部分是对一些参数的解释（看英文能懂的话，下面的解释就不用看了），而下面没#号注释的部分则是各个参数对应的具体的值 一般先关注以下几列信息，从左到右为： 颜色 ：染色体编号 POS：参考基因组上variant碱基的位置，如果是INDEL，则该位置是INDEL第一个碱基的位置 ID
2022-06-29 10:29:05
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空空如也
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