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RSS订阅原创 pyradiomics使用——1. 医学影像的组学特征值（Radiomics Features）提取
文章目录1. 使用插件1.1 插件安装1.2 插件使用2. 使用python代码2.1 安装2.2 使用2.2.1 官方示例2.2.2 快速使用2.2.3 其它使用3. 组学特征字段意义说明Github地址：https://github.com/AIM-Harvard/pyradiomics官方文档地址：https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/features.html1. 使用插件从pyradiomics的Github仓库中可以知道，pyradio
2022-05-30 09:58:28
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原创 医学影像入门知识——3. 常见工具和库说明
基调其实和其他的图像处理本质还是一样的，只是针对医学领域加入了自己的领域内容。工具3Dslicerhttps://www.bilibili.com/video/BV1HJ411S7G4这是一例CTA图像，对应的网址是利用3D slicer标注血管的方法视频，供参考学习。此外Slicer的一些学习和操作方法，也可以翻看该Up主的往期视频学习分割，配准很多功能，里面还有其他的开源算法你可以下载一个itk-snap，这个是专门看片子的软件，slicer用于处理MD.aihttps://gi
2022-05-19 15:51:34
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原创 git在团队合作中的常见使用
文章目录0. 将本地分支提交到（同名的）远程1. 将本地分支提交到远程的另一分支3. 将本地分支提交到另一个repo0. 将本地分支提交到（同名的）远程如果想将本地分支提交到远程，需要明确远程的名称已经要push的分支的名称""" 语法格式git push <remote> <branch>"""$ git push origin my-feature结果如下，本地的my-feature提交到对应远程的my-feature如果本地还没有切换到要push的分支，
2022-05-16 18:20:39
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原创 docker-compose的volume写文件提示Permission denied
文章目录1. 现象描述2. 错误原因3. 解决1. 现象描述2. 错误原因3. 解决
2022-05-12 14:27:48
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原创 SimpleITK使用——2. 进行crop操作
参考：Stack Oveflow：SimpleItk crop imageITK forum：Simple ITK Crop ImageITK forum：How to crop a 3D image with a specified size?Github issue：SimpleITK/SimpleITKSimpleITK document：Image Grid Manipulation
2022-05-06 15:45:16
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原创 git reset --hard撤销上一次commit后部分文件消失
文章目录1. 撤销上一次commit/add2. 因为reset导致部分文件消失3. 后续操作1. 撤销上一次commit/add参考：git撤销已提交的commit"git撤销上一次commit的内容"> git reset --soft HEAD^"如果需要连add的文件也一并撤销，使用命令"> git reset --hard HEAD^"""HEAD^ 表示上一个版本，即上一次的commit，也可以写成HEAD~1 如果进行两次的commit，想要都撤回，可以使用HE
2022-05-05 17:00:57
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原创 python远程开发环境总结（Eclipse+Pydev）
文章目录1. VScode系列1.1 vscode remote development插件1.2 code-server1.2.1 配置1.2. CodeSpaces1.2.1 小惊喜2. Pycharm系列2.1 pycharm for Ubuntu/linux2.2 pycharm remote development3. Pydev系列3.1 Eclipse+pydev3.1.1 Eclipse安装3.1.2 Pydev插件安装3.1.3 使用Pydev进行remote debugger3.2 L
2022-05-04 11:47:40
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原创 Exception occurred during ITK-SNAP startup
文章目录1. 报错内容2. 原因3. 解决1. 报错内容报错：Exception occurred during ITK-SNAP startup2. 原因按照上面提示的信息，找到对应的UserPreferences.xml文件，其实可以发现，与这个文件一起产生的还有另两个文件查看UserPreferences.xml文件内容，其中记录了上一次打开ITK-SNAP浏览的图像一般直接打开ITK-SNAP会显示之前打开过的图像列表而我上一次使用ITK-SNAP时，有个文件打开错误因此
2022-05-04 10:33:54
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原创 SimpleITK使用——1. 进行Resample/Resize操作
文章目录1. 变换到一个新的spacing1.1 使用Resample()的方法1.1.1 完整代码1.1.2 转换前后图像1.2 使用ResampleImageFilter()的方法2. 已知原图和变换后目标图像的大小2.1 代码2.2 转换后图像3. 相关内容说明3.0 体素和spacing3.1 Resample() 函数说明3.2 itk::simple::ResampleImageFilter函数说明1. 变换到一个新的spacing1.1 使用Resample()的方法1.1.1
2022-05-02 22:50:24
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原创 医学影像入门知识——1. 坐标轴/方向
文章目录1. 冠,矢,横/z,y,x2. AP、RL、SI等3. 补充知识3.1 人体标准解剖学姿势3.2 方位术语3.2.1 前后-Anterior (Ventral) / Posterior (Dorsal)，即AP3.2.2 上下-Superior / Inferior & Cranial / Caudal，即SI3.2.3 内外-Lateral / Medial & Proximal / Distal3.2.4 深浅Deep (Internal) / Superficial (Ext
2022-05-02 12:09:50
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原创 mac按键难回弹（按下去软软的）
原因一般是键盘里面有一些东西塞住了。操作以按键A为例，把键盘与桌面垂直放着（左侧电源插孔朝着桌面），然后不断去按A键，如果这个方向不行，换另一侧，即把键盘放置成耳机孔朝着桌面的方向，再去按A键按的时候看手感，差不多就行...
2022-05-02 11:58:13
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原创 医学影像入门知识——2. 常见术语名词总结
1. 窗宽、窗位和HU值1.1 已知窗宽和窗位，计算HUHU是CT值的单位。目前绝大多数CT机设置的CT值的范围是从±1000，范围也就是2000个。一般而言，只有当两个像素的灰度相差60个HU时，才能分辨出它们之间的黑白差，所以会用窗宽和窗位进行调节，让人眼尽量能够分辨出灰度的差异。假设 WW = 400,WL = 60,那么对应的CT(HU)范围为-140 ~ 260H窗宽（Window Width,简写WW）窗位（Window Level,简写WL）以窗位为中心，向左
2022-04-29 09:54:33
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原创 DICOM-RT struct使用python脚本转换为nii.gz
其实Github上有很多这样的库和脚本，但是都大同小异，掌握关键那部分代码就可以。要明确一点，SimpleITK不支持对DICOM-RT struct格式大部分脚本都是用pydicom读取，然后再用numpy等进行切片等操作。1. 使用MIScnn库来完成转换安装sudo pip install miscnn # linuxpip install miscnn --user # Windows使用from miscnn.data_loading.interfaces.dicom_io
2022-04-26 20:46:22
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原创 训练过程出现trian_dice一直大于1（mask范围0-255转为0-1）
文章目录0. 背景知识0.1 mask0.2 SimpleITK快速入门1. 使用Threshold类方法1.1 sitk.RescaleIntensityImageFilter1.1.1 代码1.1.2 函数说明1.2 sitk.Threshold1.2.1 代码1.2.2 sitk.Threshold函数说明1.3 sitk.BinaryThreshold1.3.1 代码1.3.2 sitk.BinaryThreshold函数说明1.4 使用`OtsuThreshold`1.4.1 代码1.4.2 s
2022-04-26 14:42:13
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KB3004394 win8-x86（紧急的受信任的根更新 Windows Windows 中的根证书程序的支持）
2022-02-11
KB3004394 win8.1-x64（紧急的受信任的根更新 Windows Windows 中的根证书程序的支持）
2022-02-11
KB3004394 win8-x86（紧急的受信任的根更新 Windows Windows 中的根证书程序的支持）
2022-02-11
KB3004394 win8 x64（紧急的受信任的根更新 Windows Windows 中的根证书程序的支持）
2022-02-11
KB3004394 win7-x86（紧急的受信任的根更新 Windows Windows 中的根证书程序的支持）
2022-02-11
KB3004394 win7-x64（紧急的受信任的根更新 Windows Windows 中的根证书程序的支持）
2022-02-11
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