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本文介绍了如何将DICOM-RT结构文件转换为nii.gz格式，主要通过3D Slicer软件的SlicerRT扩展进行操作，包括下载扩展、加载DICOM文件和RTSTRUCT、以及两种导出RT-struct为nii.gz的方法。此外，还讨论了在转换后遇到的nii文件过大问题，并提供了通过SimpleITK进行数据类型转换以减小文件体积的解决方案。
接触到这种数据格式是因为AAPM比赛论坛（LCTSC2017数据集），因此以下内容都是围绕这个数据集展开。
1. 代码实现
关于RTSTRUCT格式，经常用于表示分割中的mask数据，但是需要对RTSTRUCT的勾画坐标数据转换成用于显示的有效坐标。
以下结果是来自LCTSC2017数据集的代码（使用了pydicom），完整代码位于：Contour extraction for LCTSC challenge.
参考：
- ✅ github的repo：Sikerdebaard/dcmrtstruct2nii
- ✅ DICOM标准浏览器：
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