山东大学软件学院创新实训——项目记录（二）

基于多模态数据的脑卒中病人健康评估与预测系统

我的任务

我将使用MATLAB对当前所有数据中的近红外数据进行处理。

背景知识学习

EEG vs MRI vs fMRI vs fNIRS

fNIRS即近红外脑功能成像技术，目前来说，越来越多的科研院所选择使用fNIRS作为探索脑功能常见的技术手段。它不同于脑电（EEG），也不同于功能磁共振（fMRI），有着自己的优势与特点。

EEG
脑细胞无时无刻不在进行自发性、节律性、综合性的电活动。将这种电活动的电位作为纵轴，时间为横轴，记录下来的电位与时间相互关系的平面图即为脑电图（electroencephalograph，EEG）。——来自彭薇薇老师
EEG信号的测量，这对于快速确定大脑活动如何响应刺激而变化是有用的，并且还可用于测量异常活动，例如癫痫。

EEG设备的一个缺点是空间分辨率。由于电极测量大脑表面的电活动，很难知道信号是在表面附近（在皮质中）还是在更深的区域产生的准确性。当然也有人通过计算的方法将采集的eeg信号进行反演到脑区位置，这是可能的，但这也不是绝对的精确。

MRI
MRI（磁共振成像）提供了大脑的图谱，这种结构信息可用于确定某些大脑区域的大小如何在人与人之间进行比较或者特定大脑（例如肿瘤）是否存在异常。

MRI只向我们展示了大脑的静态图像——一个解剖图像，而不是大脑的实际活动。那么我们如何才能获得大脑活动的图像呢？这就是fMRI的用武之地。

fMRI
如果我想移动我的右臂，需要做一些事情：一个我的大脑的某些部分将增加其活动发送消息来完成这个动作，而大脑的该区域将得到不断所谓稍微富含氧气的血液。
对于fMRI，同样的事情发生在MRI上——测量质子弛豫释放的能量，但计算的目的是确定氧合血流量的变化情况。
如果大脑的一部分与其他部位相比有更多的含氧血液，那么这个大脑区域可能更活跃。这被称为血氧水平依赖性反应（也称为BOLD）。

fMRI的一个缺点是时间分辨率。由于血流需要几秒钟的变化，并且实际记录受到计算因素的限制，因此数据收集速度变慢。
这通常意味着参与者多次暴露于刺激，并且每次记录他们的大脑反应的不同时间点（例如，在第一次刺激开始时，第二次刺激开始后10ms，等等时记录响应）。
这当然会破坏记录新反应的准确性，但确实提供了全方位的大脑反应。——来源Imotion

fNIRS
是一种使用光谱法测量大脑神经活动水平的神经成像方法。
它探测的主要生理参数：组织中吸收色团（如HbO2、Hb、totalHb等）的浓度变化。
通过放置在我们大脑头上的光源和探测器进行局部血流信号的测量。
这通常意味着测量脑区的大小，取决于光源和探测器的排布以及设备的支持。fNIRS在这几种技术中最大的优势在于其时间分辨率比fMRI技术快，空间分辨率比EEG技术大，还有更重要的特点在于其便携性和伪影干扰小。

由于我们拥有多种数据，将会通过多模态手段对 EEG-fNIRS-fMRI 这一系列数据进行整体分析与使用。

认识近红外设备仪器

近红外的设备有很多，有进口设备也有国产设备。目前来说，国内使用比较多的设备有hitachi（日立）、shimadzu(岛津)、NIRx设备，这几款设备都是进口设备，在国内还有国产的设备厂商，丹阳慧创，武汉资联虹康也自主研制近红外设备。

我们的数据由丹阳慧创的设备产生。

NIRS-KIT介绍

NIRS-KIT是北师大朱朝喆老师研究团队于2019年发布的一款同时支持任务态和静息态 fNIRS 数据分析的图形化界面软件。该工具箱涵盖了近红外数据整个分析流程，包括数据准备、质量检查、预处理、个体水平分析、组水平统计和结果可视化。对于任务 fNIRS 数据，基于 GLM 进行个体层面的分析以检测与任务相关的神经激活。对于静息状态 fNIRS 数据，可以计算个体水平的功能连接 (FC)、ALFF/fALFF 和网络指标。对于组水平分析，NIRS-KIT 提供了几种流行的参数模型和多重比较校正方法。NIRS-KIT 提供多种可视化功能，将统计结果可视化。21年7月，NIRS-ICA集成到 NIRS-KIT，NIRS-ICA用于去除 fNIRS 噪声和提取神经活动相关源，进一步丰富了NIRS-KIT数据处理的功能。

公众号文章 EEG vs MRI vs fMRI vs fNIRS
参考文章链接：https://www.jianshu.com/p/3185a4c436c9