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ls -alFh Uyghur.affymetrix.chr*sample
2016-05-19 15:52:07
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原创 用X11 在R下面画图
登服务器的时候加 -X ， 它会自动打开本地的X11.这个时候在服务器的R下面画图没有问题。但是如果登入后长时间没有用X11.本地和服务器会断开链接，这个时候需要重新等下服务器。另外，tmux下可能X11不能用。
2016-04-07 20:21:29
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原创 R 装包
我用的r是自己装。如何查看：which R那么装包的时候进入r。 然后install.packages("package name")即可。
2015-12-17 16:33:38
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原创 R - plot(density)
画密度分布图的时候。1）如果想只取某一范围(x, y)的数值，不要直接把范围外的数值删掉。可用 R 中参数: from=x, to=y.2）画密度分布图时它会根据数值范围来划bin，这样当数值范围很大时，细小的波动便看不到了。于是我们可以调bin的宽度。width＝z （z可以为0.1或更小，根据自己需要的resolution）example：plot(de
2015-10-20 15:37:10
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转载 R作图控制坐标轴刻度的个数和标注
R作图控制坐标轴刻度的个数和标注 (2013-04-27 16:59:26)转载▼标签： 杂谈分类： R统计ILoveLittree 2013/04/27 控制坐标轴中刻度的个数，方向，刻度的标注，以及刻度的标注用到plot()中的xaxt,yaxt和axis低绘图参数等。这里面就不贴图了，
2015-09-08 21:59:47
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原创 tabix
tabix /picb/humpopg6/yuankai/QQ/AAGC259Pop6.phased.vcf.gz 2:30000-31000 -h
2015-08-16 17:50:55
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转载 R RGB color
所有的颜色都是基于red, blue, green 调出来的。如果想知道你需要的颜色，在R中输入col2rgb('specific color', alpha=T)详细说明：It's the usual #RRGGBB color notation, w/ the last two digits apparently defining the amount of opaci
2015-07-24 16:34:54
2121
转载 Linux 更改打开PDF方式
以pdf文件为例，我的机器上pdf都是用adobe reader默认打开的，我想更改为预览打开1.右键选中要打开的文件，弹出右键菜单，点击“显示简介”这个菜单项。。2。弹出文件的简介，下面有一栏“打开方式”，把这个栏目打开3。选择打开方式的程序为“预览”即可。但是这个时候只是更改了这一个文件的打开方式，以后这个文件就是用“预览”打开，其他的PDF文件还是默认
2015-05-20 09:22:50
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转载 如何计算case control之间的卡方值
x2检验（chi-square test）或称卡方检验 x2检验（chi-square test）或称卡方检验，是一种用途较广的假设检验方法。可以分为成组比较（不配对资料）和个别比较（配对，或同一对象两种处理的比较）两类。 一、四格表资料的x2检验 例20.7某医院分别用化学疗法和化疗结合放射治疗卵巢癌肿患者，结果如表20-11，问两种疗法有无差别？
2015-04-14 09:26:09
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原创 R in action - chapter2 数据结构 ~ chapter6 基本图形~chapter11 中级绘图~chapter16高级绘图
R 中得数据结构： 向量 ： 同一向量无法hu
2014-11-07 20:55:51
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转载 perl 装包
inux系统已经自带了perl,但是如果需要某一个模块的时候，可以单独安装模块 如果你有root权限，你可以使用CANP，如果你没有root权限，那么bbsunchen教你使用如下方式1. 安装模块进入模块所在路径，就是你的模块放在哪里，你就cd进去，然后执行下面的命令...perl Makefile.PL PREFIX=/home/fengqidimake
2014-08-30 16:19:51
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原创 An Introduction to Bioinformatics Algorithms - III - Chapter5 Greedy Algorithm
Biological Problem:Rearrangement often happened in mammalian evolutionary history. For example, human X chromosome
2014-08-09 21:03:03
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原创 How to check the size of file/directory ?
du filename/directory : show in bytedu -h filename/directory : show in M or Gdu -ah directory : sh
2014-07-22 15:06:42
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转载 What does "ls -l" show?
第1行:总计(total) Total后面的数字是指当前目录下所有文件所占用的空间总和。可以使用ls –lh查看，也可使用ls –alh查看。
2014-07-22 12:40:38
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原创 An Introduction to Bioinformatics Algorithms - II - page79 -114
Finally step into the world of Algorithm...
2014-07-14 21:45:33
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原创 An Introduction to Bioinformatics Algorithms - I - page1-78
6/24 give me example what is pseudocode; 6/25 biological algorithm is even more complicated than computer algorithm; how to solve change problem. 6/28. Use Fibonacci to illustrate the difference betwe
2014-07-14 20:54:30
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转载 chomp 和 $/
【转】[Perl]chomp 和 $/chomp用来去掉字符串结尾的空行，这是我之前的理解。今天仔细看了chomp的文档，原来chomp不一定只用来删除字符串结尾的空行，它可以删除结尾的$/， 只不过$/的默认值是newline，所以给人的感觉chomp总是用来删除结尾的空行。通过改变$/的默认值，可以让chomp变得更灵活。比如你的某个变量$var结尾有多个空行，
2014-07-03 21:13:03
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空空如也
空空如也
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