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原创 Barrnap的安装及使用
Barrnap的安装及使用Barrnap作为开源的rRNA预测软件,比较方便使用,但在安装的过程中遇到了一些问题,在这里记录一下。
2024-01-27 00:11:36
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原创 PICRUSt2结果注释:官方命令
在上一篇分享了按照刘老师的脚本方法将PICRUSt2预测得到结果注释到KEGG通路上,但后来发现网络上有其他小伙伴分享了PICRUSt2官方的注释命令。我将两个命令得到的结果进行了对比,还是有差别。咨询过刘老师后,刘老师建议还是以官方的为准。现在更新一下PICRUSt2结果注释的官方命令:
2022-10-24 20:08:38
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原创 bioconductor常用包(GO.db等)安装问题
项目场景:在绘制微生物相互作用网络时,需要用R语言的igraph计算相关的参数。其中需要用到bioconductor的各类包,尤其是WGCNA是函数计算使用的前提。问题描述在R4.0.3安装bioconductor的常用包时,所使用的代码是:package_list <- c("digest","AnnotationDbi", "impute", "GO.db", "preprocessCore","WGCNA","multtest")for(p in package_list){ i
2022-04-18 21:18:00
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空空如也
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