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原创 CDR useful review
CNVCopy umber variation (CNV)SNP,SNV是什么Single Nucleotide Polymorphism(SNP) 在基因组(DNA序列)中特定位置的单核苷酸的变异Single Nucleotide Variant (SNV) 无任何频率限制的单一核苷酸的变异,包括体细胞PS:在生物群体中这种基因变异的发生频率,大于1%称为SNP;小于1%的称为点突变 (mutation)。什么用许多科学性的文献证实SNP与特定疾病具有关联性。如:黄斑部病变、大肠癌、子宫
2020-07-30 12:58:20 319
原创 非负矩阵分解 低秩矩阵分解
非负矩阵分解 NMF一般的矩阵分解,分解的矩阵有正有负。 很多实际应用中,负数没有意义,如文本等等。 NMF中要求原矩阵和分解后矩阵都为非负矩阵,这个分解存在唯一。 引入稀疏,局部计算。以人脸识别为例: V∈Rn×m+V∈R+n×mV\in R_+^{n\times m} m张脸,每张图n个像素 W∈Rn×r+W∈R+n×rW\in R_+^{n\times r} 基矩阵,每一列...
2019-03-02 16:32:00 1735
原创 梯度下降查询表
GD 公式 备注 BGD θ=θ−η∇J(θ)θ=θ−η∇J(θ)\theta=\theta-\eta\nabla J(\theta) SGD θ=θ−η∇J(θ;x(i),y(i))θ=θ−η∇J(θ;x(i),y(i))\theta=\theta-\eta\nabla J(\theta;x^{(i)},y^{(i)}) Mini-...
2019-03-02 16:30:40 284
原创 降维 LDA PCA SVM
降维线性判别分析 LDALDA是什么?Two-class LDA (见PPT)优缺点主成分分析 PCA基于投影距离的PCA支持向量机 SVM核方法 Kernel Methods降维线性判别分析 LDALDA是什么?LDA是有监督学习中的降维方法,是线性分类器和高斯模型的结合。在低维度上进行投影,投影后希望每一种类别数据的投影点...
2019-03-02 16:13:35 1801
原创 Random Walk, Markov Chain
提纲什么是随机过程什么是马尔可夫链什么是随机游走什么是图上的随机游走,与随机游走的区别什么是随机过程对比:确定过程研究某个量随时间的变化;随机过程研究某个量随时间的可能变化,每个时刻变化的方向(取值)不确定。定义:由一系列随机变量组成。每一个时刻系统的状态都由一个随机变量表示,而整个过程则构成态空间的一个轨迹(随机过程的实现)。一个随机过程最终实现,会得到一组随时间变化的数值(...
2019-03-02 16:09:23 2412 1
空空如也
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