hdu 2457 DNA repair AC自动机+DP

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题目链接:http://acm.hdu.edu.cn/showproblem.php?pid=2457

这道题用不到query函数,直接在带fail的字典树上面进行dp。

明确两点:

①:所有串insert之后builfail会将所有next=-1的指针指向根节点

②:正常查询时若查到一个有标记值的点,需要不断向上遍历fail节点,因为fail是其最长后缀,其出现则其后缀也一定出现。

但这道题中不需要用query,所以可以更接近底层的将每个点的标记值传给以它为fail的节点,这个操作在buildfail中bfs的时候可以顺便实现。

其次就是dp,dp【i】【j】代表当前写了i个字符,到达了字典树的第j个节点。假如对一个节点j,其有next节点k,则更新:

                                                       dp[i][k]=min(dp[i][k],dp[i-1][j]+(change_int(no[i])==k))

(其中no为匹配串,即这道题中的原DNA串,change_int用来将A、C、G、T转化成0~3的数字)

最后dp【len】【i】中的最小值,i是字典树节点集合。若其依旧为最开始初始化的值(inf),说明不可修改为正确DNA,输出-1。否则输出其值。

#include<bits/stdc++.h>
int inf;

using namespace std;



const int maxn=20+10;///多个模式串长度
const int N=1000+10;///文章长度
const int lettersize=4;///看种类

char s[maxn];
char no[N];

int pin(char x)
{
    switch(x)
    {
        case 'A':return 0;
        case 'C':return 1;
        case 'G':return 2;
        case 'T':return 3;
    }
    return 0;
}

const int MAX=1e6+10;
int dp[1010][1010];
struct Trie
{
    int next[MAX][lettersize],fail[MAX],end[MAX];
    int root,L;///root为根 L为点数
    int newnode()
    {
        for (int i=0;i<lettersize;i++)
            next[L][i]=-1;
        end[L++]=0;
        return L-1;
    }
    void init()
    {
        L=0;
        root=newnode();
        memset(dp,1,sizeof dp);
        inf = dp[0][0];
    }
    void insert(char *buf)
    {
        int len=strlen(buf);
        int now=root;
        for (int i=0;i<len;i++)
        {
            int pos=pin(buf[i]);
            if (next[now][pos]==-1)
                next[now][pos]=newnode();
            now=next[now][pos];
        }
        end[now]++;
    }
    void build ()
    {
        queue<int >Q;
        fail[root]=root;
        for (int i=0;i<lettersize;i++)
            if (next[root][i]==-1)
                next[root][i]=root;
            else
            {
                fail[next[root][i]]=root;
                Q.push(next[root][i]);
            }
        while (!Q.empty())
        {
            int now=Q.front();
            Q.pop();
            if(end[fail[now]])
                end[now]=1;
            for (int i=0;i<lettersize;i++)
                if (next[now][i]==-1)
                    next[now][i]=next[fail[now]][i];
                else
                {
                    fail[next[now][i]]=next[fail[now]][i];
                    Q.push(next[now][i]);
                }
        }
    }
}ac;


int main()
{
//    freopen("1.txt","r",stdin);
//    freopen("3.txt","w",stdout);
    int t=1;
    int n;
    while(~scanf("%d",&n))
    {
        if(n==0)
            break;
        ac.init();
        for(int i=1;i<=n;i++)
            scanf("%s",s),ac.insert(s);


        ac.build();

        scanf("%s",no+1);
        int len=strlen(no+1);
        dp[0][0]=0;
        for(int i=1;i<=len;i++)
        {
            for(int j=0;j<ac.L;j++)
            {
                if(dp[i-1][j]==inf)
                    continue;
                for(int k=0;k<4;k++)
                {
                    int son=ac.next[j][k];
                    if(ac.end[son]!=0)
                        continue;
                    dp[i][son]=min(dp[i][son],dp[i-1][j]+(pin(no[i])!=k));

                }
            }
        }

//        for(int i=1;i<=len;i++)
//        for(int j=0;j<ac.L;j++)
//            printf("dp[%d][%d]=%d\n",i,j,dp[i][j]);
//for(int i=0;i<ac.L;i++)
//    for(int j=1;j<=3;j++)
//        printf("next[%d][%d]=%d\n",i,j,ac.next[i][j]);
//for(int i=0;i<ac.L;i++)
//    printf("end[%d]=%d\n",i,ac.end[i]);

        int ans=inf;
        for(int i=0;i<ac.L;i++)
            if(!ac.end[i])
                ans=min(ans,dp[len][i]);
        if(ans==inf)
            printf("Case %d: -1\n",t++);
        else
            printf("Case %d: %d\n",t++,ans);
    }
    return 0;
}

 

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