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原创 Trim Galero(学习记录-自用)
自动搜选的平台三个,也直接显式输入这三种平台,即--illumina、--nextera和--small_rna。--retain_unpaired:对于双端测序结果,一对reads中,如果一个read达到标准,但是对应的另一个要被抛弃,达到标准的read会被单独保存为一个文件。即小于20bp的被去除。:对于双端测序结果,一对reads中,如果有一个被剔除,那么另一个会被同样抛弃,而不管是否达到标准。-s/--stringency<INT>:设定可以忍受的前后adapter重叠的碱基数,
2024-08-03 18:44:55
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原创 SAHMI(学习记录-自用)
肿瘤内微生物特征与整体生存率的关联。如:Clostridioides difficile共定位的肿瘤细胞中,EDIL3基因的表达显著增加,然后查看EDIL3在共定位/没有共定位的细胞中的表达水平。A:横横轴表示在与细菌共定位的细胞中与未共定位的细胞相比的基因表达的平均log2倍数变化,纵轴表示Wilcoxon测试的假发现率(FDR)校正p值。与没有细胞相关细菌的肿瘤相比,携带细胞相关细菌的肿瘤中的T细胞更有可能具有激活的表型(即自然杀伤性T细胞、效应性T细胞),而不太可能具有调节性表型(我没看出来啊)
2024-07-16 15:45:07
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空空如也
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