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原创 pymol可视化蛋白质-蛋白质相互作用
点击“3-Button Viewing”变为“3-Button Editing”,似乎点击后下次开启就自动变为Editing了,然后在长按ctrl键的前提下,鼠标长按移动可改变位点编号的位置。pymol中特有的对象是“图层”(之后会用到),它初始在object上表示为(sele),但是其实其真实名称就是sele,因此修改名称时正确输入为。由于表示化学键时,蛋白质结构最好用球棍模型(stick)来表示,给出一种高级的,只在相互作用附近展示球棍模型,大部分保留卡通模型的命令。然后,突触图层文件的成键情况。
2023-10-12 22:40:26
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原创 在Ubuntu on Windows中忘记密码怎么办?
windows上稀里糊涂有两个Linux,这是因为:在我知道Windows上可以运行Linux这件事情的时候,我首先下载了一个Ubuntu 18.04.6 LTS,可以使用,但是在一些步骤上出错;此外,我还惊讶地发现有一个Ubuntu on Windows,这个应该是我之前上课时稀里糊涂安装的(有点点印象,但是当时也没有下载,而是用cmd命令行启动的)。在Ubuntu 18.04.6 LTS中遇到某个问题时,我尝试用Ubuntu on Windows尝试,但是,发现我忘记了密码!
2023-09-18 13:47:43
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原创 失败的用Linux安装US-align
奇怪的是,这个Linux系统是中文,而且居然没有自带的g++,安装g++时没有识别g++反而识别成了“g+”,非常奇怪,解决办法可能要后续重新安装正版的Linux,这个其实是一个LTS?看CSDN博客,发现改密码都是建立在虚拟机基础上,有那个界面,直接用命令行改密码的也有,可能是我太菜了,不知道怎么改,这个可能又是之后几天的一个任务了哈哈。1. wget命令可以获取网址中提供的代码,这些代码是以C++命令行的形式存在于网站的,因此导入之后可直接视为跑这些程序。3. 失败原因2:忘记密码!
2023-09-17 08:58:31
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原创 Windows运行USalign多结构比对MSTA的经验教训
(2)其实并不是为了得到这个进化树,DALI甚至就够了,而是要在这个过程中对生物信息研究全方位有所了解,当然今天给的时间太多了,还要准备文献,但是那个文献最后也是要对生信分析有一个全貌的认识;今天那个问题,困扰很久,ChatGPT也没有解决,更不用说CSDN,知乎了,但是老张一看,就知道:空格很重要,/后有空格说明是下级文件;注意:官网上的示例都是Linux的,虽然不知道这个鬼东西有什么好的,但是一个区别是windows中的斜杠是向左上的\,而Linux中的斜杠是向右上的/计算机极致小白的经验贴。
2023-09-09 16:22:21
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空空如也
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