nnUNet一个医学图像分割神仙算法

很多年之前接触过UNet的细胞分割，这次突然拿出来做一个三维的腿骨分割，突然有点不知所措了，可能我的技术只局限于二维的吧，经过一个月的研究差不多鼓捣明白了一点，欢迎有经验的大佬赐教一些知识，我这就写写我自己做的过程吧。

一 训练前的准备工作     

1. 算法框架搭建以及环境配置 

必要程序，环境就搞了我好多天，以为虚拟机就够了，结果配置还是不行，果断换成双系统，这个就不写了，网上太多了而且也不难，我以前都是用的虚拟机或者纯ubuntu系统没有装过，网上找了找一天也搞完了。

a.        操作系统：ubuntu18.04

           Ubuntu 18.04.6 LTS (Bionic Beaver)

b.         NVIDIA驱动：nvidia465.27（对应自己电脑配置在官网查看对应版本下载安装）

           NVIDIA 驱动程序下载

c.         pytorch:1.8.0                        Previous PyTorch Versions | PyTorch

            CUDA:11.1      

            CUDNN:11.1

     # CUDA 11.1     
       conda install pytorch==1.8.0 torchvision==0.9.0 torchaudio==0.8.0 cudatoolkit=11.1 -c pytorch -c conda-forge

d.        Annaconda3:python3.6.9     

            这个在官网下载很慢，下面链接差不多可以达到1MB/s，还是不错的，找到对应的python版本即可，没有非要跟我一样，看你自己用哪个版本但是不要太高也不要太低。