Problem Address:http://poj.org/problem?id=1080
【思路】
一道LCS的变形。
设空格为0,A为1,C为2,G为3,T为4。
状态转移方程:dp[i][j] = max(dp[i-1][j-1]+value[a[i]][b[j]], dp[i-1][j]+value[a[i]][0], dp[i][j-1]+value[0][b[j]]);
对于边界,即三个值中有某些值无法取到时,将其忽视。
即:
dp[0][0] = 0;
dp[i][0] = dp[i-1][0] + value[a[i]][0];
dp[0][j] = dp[0][j-1] + value[0][b[j]];
【代码】
#include <iostream>
using namespace std;
const int maxn = 100;
int value[5][5] = {
{0, -3, -4, -2, -1},
{-3, 5, -1, -2, -1},
{-4, -1, 5, -3, -2},
{-2, -2, -3, 5, -2},
{-1, -1, -2, -2, 5}};
int dp[maxn+5][maxn+5];
char sa[maxn+5];
char sb[maxn+5];
int a[maxn+5];
int b[maxn+5];
inline int getcode(char c)
{
if (c=='A') return 1;
else if (c=='C') return 2;
else if (c=='G') return 3;
else if (c=='T') return 4;
else return 0;
}
inline int max(int x, int y, int z)
{
if (x<y) x=y;
if (x<z) x=z;
return x;
}
int main()
{
int t;
int la, lb;
int i, j;
scanf("%d", &t);
while(t--)
{
scanf("%d %s", &la, sa);
scanf("%d %s", &lb, sb);
for (i=0; i<la; i++)//先转换为整型数组
a[i+1] = getcode(sa[i]);
for (i=0; i<lb; i++)
b[i+1] = getcode(sb[i]);
dp[0][0] = 0;//初始化各边界
for (i=1; i<=la; i++)
dp[i][0] = dp[i-1][0] + value[a[i]][0];
for (j=1; j<=lb; j++)
dp[0][j] = dp[0][j-1] + value[0][b[j]];
for (i=1; i<=la; i++)//开始dp
{
for (j=1; j<=lb; j++)
{
dp[i][j] = max(dp[i-1][j-1]+value[a[i]][b[j]], dp[i-1][j]+value[a[i]][0], dp[i][j-1]+value[0][b[j]]);
}
}
printf("%d\n", dp[la][lb]);
}
return 0;
}