R语言编程实现决策曲线分析及DCA曲线绘制

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本文介绍了如何使用R语言进行决策曲线分析(DCA),旨在评估和比较预测模型在临床应用的效果。通过数据集的预处理、逻辑回归模型构建、ROC曲线绘制,最终利用DCA计算模型的净收益并绘制决策曲线,帮助确定最佳决策阈值,对于医疗决策具有指导意义。
摘要由CSDN通过智能技术生成

R语言编程实现决策曲线分析及DCA曲线绘制

决策曲线分析(Decision Curve Analysis,DCA)是一种常用的统计方法,用于评估和比较预测模型在不同患者群体中的临床应用效果。在本文中,我们将使用R语言自定义编程来实现决策曲线分析,并通过绘制DCA曲线来展示其应用。

首先,我们需要准备数据集。假设我们有一个二分类问题的数据集,其中包含了患者的特征和一个二元变量作为标签,表示是否患有某种疾病。我们将使用该数据集进行模型构建和决策曲线分析。

# 导入所需的库
library(pROC)
library(DCA)

# 读取数据集
data <- read.csv("data.csv")

# 将数据集分为训练集和测试集
set.seed(123)
train_index <- sample(1:nrow(data), nrow(data)*0.7)
train_data <- data[train_index, ]
test_data <- data[-train_index, ]

# 构建逻辑回归模型
model <- glm(label ~ ., data=train_data, family=binomial)

# 在测试集上进行预测
predictions <- predict(model, newdata=test_data, type="response")

# 计算真正率和假正率
roc <- ro
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