【影像组学pyradiomics教程】（四） pyradiomics模块--Feature Extractor（特征抽取器）

最新推荐文章于 2024-04-27 01:15:34 发布

JianJuly

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分类专栏：影像组学pyradiomics教程文章标签： python pyradiomics 影像组学

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class radiomics.featureextractor.RadiomicsFeaturesExtractor(*args, **kwargs)

特征抽取器是一个封装的类，用于计算影像组学特征。大量设置可用于个性化特征抽取，包括：需要抽取的特征类别及其对应特征；需要使用的图像类别（原始图像/或衍生图像）；需要进行什么样的预处理。
特征抽取器是一个封装的类，用于计算影像组学特征。大量设置可用于个性化特征抽取，包括：需要抽取的特征类别及其对应特征；需要使用的图像类别（原始图像/或衍生图像）；需要进行什么样的预处理。
我们可以使用该类的execute()方法来执行特征抽取操作。execute接受的参数为原始图像及其对应的Mask。
初始化特征抽取器的方式可二选一：一、通过将参数文件的位置作为唯一参数传递给特征抽取器来对其进行初始化，在这种情况下，任何其他的参数都会被忽略；二、通过关键字的方法对setting进行初始化（注意：imageType和featureClass不能通过这种方式初始化，而只能通过调用函数的方式进行初始化）。
默认情况下，所有的特征类别、所有的特征都处于激活状态；
默认情况下；只有原始图像处于激活状态。

addProvenance(provenance_on=True)
用于展示信息

loadParams(paramsFile)
用于加载参数文件来更新参数设置。如果出现不匹配，则报错：pykwalify error

enableAllImageTypes()
使用默认参数激活所有图像类别

disableAllImageTypes()

enableImageTypeByName(imageType, enabled=True, customArgs=None)

enableImageTypes(**enabledImagetypes)

enableAllFeatures()

激活所有的特征类别和对应的所有特征
标记为deprecated的特征不可通过这种方法激活，但仍然可以通过enableFeatureByName()、enableFeaturesByName()及参数文件等方法激活

disableAllFeatures()
关闭所有的特征类别及其所有特征

enableFeatureClassByName(featureClass, enabled=True)

激活或者关闭特定的特征类别
标记为deprecated的特征不可通过这种方法激活，但仍然可以通过 enableFeatureByName()、enableFeaturesByName()及参数文件等方法激活

enableFeaturesByName(**enabledFeatures)

execute(imageFilepath, maskFilepath, label=None)

执行特征抽取操作，包含以下操作：

输入参数

返回值

包含特征的字典
- 键名：图像类别_ 特征类别_特征名（例如original_firstorder_MeanAbsoluteDeviation）
- 键值：特征值

loadImage(ImageFilePath, MaskFilePath)

加载预原始图像及Mask，并对其进行预处理

如果归一化被激活，则在任何重采样之前先执行归一化

getProvenance(imageFilepath, maskFilepath, mask)

用于生成附加信息以便能够进行重复试验
参数之一的mask是已经归一化和重采样后的图片
返回值：以“general_info_”为键名的字典，例如 general_info_BoundingBox : (162, 84, 11, 47, 70, 7)

computeFeatures(image, mask, imageTypeName, **kwargs)

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