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原创 RMysql

安装时注意mysql为32位,rjava也要32位。#连接到服务器ucscDb<-dbConnect(MySQL(),user="genome",host="genome-mysql.cse.ucsc.edu")#获得数据库result<-dbGetQuery(ucscDb,"show databases;")#连接到指定数据库hg19<-dbConnect(MySQL(),user="

2014-04-22 20:14:36 697

原创 Rmysql

安装时注意mysql为32位,#连接到服务器ucscDb<-dbConnect(MySQL(),user="genome",host="genome-mysql.cse.ucsc.edu")#获得数据库result<-dbGetQuery(ucscDb,"show databases;")#连接到指定数据库hg19<-dbConnect(MySQL(),user="genome",db=

2014-04-22 20:14:09 648

翻译 hdf5

source("http://bioconductor.org/biocLite.R")biocLite("rhdf5")library(rhdf5)create = h5createFile("example.h5")getwd()create=h5createGroup("example.h5","foo")create=h5createGroup("example.h5","ba

2014-04-22 20:11:22 1187

原创 week 2

GIT下载git:http://git-scm.com/downloads安装git:默认下一步使用:1.设置用户名,邮箱:git config --global user.name ""git config --global user.email ""检查:git config --list2.退出exit新建本地gitmkdir

2014-04-17 20:13:38 650

原创 week1

目录操作getwd();setwd('../')if(!file.exists(directoryname)){ dir.create(directoryname)}下载

2014-04-13 10:10:48 840

原创 Week 1

目录getwd();setwd('c:/');

2014-04-08 22:15:58 533

原创

随机数生成%产生1到m之间的随机数生成器rand_indices = randperm(m);%生成100个,返回一个向量sel = X(rand_indices(1:100),:);

2014-04-07 16:15:56 673

原创 linear regression几个代码

J = 0;grad = zeros(size(theta));%对于y=1,cost为 -log[h(x)] % y=0,cost为 -log[1-h(x)]%J可以表示为 - log[| if(y==0,1,0) -h(x) |] if(判断,true的输出值,false的输出值)z = X*theta;neg=find(y==0);tmp

2014-03-30 11:10:04 964

原创 牛顿法求解柯西分布参数的最大似然估计(P055)

1.牛顿法求方程根假设f(x)在x=a处取到0,即f(a)=0。已知c在a的附近,有a=c+Δx。根据泰勒公式展开,省略高次项,得2.简单代码实现newt_cauchy.R    cauchy_mle=function(x,theta){ sum = 0; for(i in 1:length(x)){ sum = sum+(x[i]-theta)

2014-03-27 22:06:33 9711 2

空空如也

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