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RSS订阅原创 关于单细胞测序代码出现KeyError: ‘CST3‘的问题
在学习单细胞测序数据分析时，发现使用别人的相关代码处理自己数据库搜索的数据，可能在PCA降维处理会出现KeyError:'CST3'错误。这可能是因为自己的数据的细胞基因marker不是CST3，这需要查询相关文献了解所使用数据的。
2024-08-06 11:59:38
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原创 单细胞测序的了解
单细胞技术通过分离单细胞进行测序，可以分析组织中存在的细胞类型，鉴定细胞的状态，研究细胞间的异质性，通过单细胞水平的基因表达变化揭示分化发育、疾病发生发展、肿瘤耐药等分子机制。进行测序分析的技术。scRNA-seq可以揭示细胞的类型、状态、功能和相互作用，以及细胞在发育、分化、疾病等过程中的。但随着技术的不断进步和成本的下降，这些问题将不断改善。单细胞测序技术作为单细胞技术中的关键一步，它的应用与单细胞技术一致。、单细胞测序技术在多个领域都展现出了强大的应用前景，为科学研究提供了新的工具和方法。
2024-07-12 17:29:14
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原创 windows下子系统Linux中illumina数据拼接
#单端数据 fastp -i filename.fastq.gz -o filename_clean.fastq.gz ##双端数据 fastp -i filename.fastq.gz -o filename_clean.fastq.gz -I filename2.fastq.gz -O filename2_clean.fastq.gz。创建一个关于bam的索引文件,我们得到 aln-pe.sorted.bam.bai的文件。3、使用samtools软件。IGV软件可视化结果。2、bwa 软件比对。
2023-07-25 09:03:56
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空空如也
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