数据文件nc6oa.txt由33个癌细胞系得6830个基因表达数据构成,每一个细胞系都是某种类型的癌细胞的类型。请按照基因表达数据对33个细胞系进行聚类(聚类类别数划是癌细胞的类型个数,比如乳腺癌、肺

这篇博客探讨了如何利用基因表达数据对33个癌细胞系进行聚类,涉及乳腺癌、肺癌等不同类型的癌症。首先通过PCA降维处理,降至27维保持95%以上方差。然后使用k-means聚类方法,得出最佳聚类数目为4类。作者详细介绍了程序实现、结果展示及分析。

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数据文件nc6oa.txt由33个癌细胞系得6830个基因表达数据构成,每一个细胞系都是某种类型的癌细胞的类型。请按照基因表达数据对33个细胞系进行聚类(聚类类别数划是癌细胞的类型个数,比如乳腺癌、肺癌、肾癌、结肠癌、白血病、卵巣癌等等),并请说明为什么聚成这些类别?(自己新建Word文档,先写程序及程序的结果,分析结果,最后以附件的形式上传word文档

data <- read.table("nci604.txt")

由于列比较多,有6830个,因此建议第一步做PCA降维处理

pca1<-prcomp(as.matrix
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