R语言统计与绘图:生存曲线的两两比较

本文介绍了如何在R语言中使用survminer包的pairwise_survdiff()函数进行生存曲线的两两比较。通过分析colon数据集中的rx和extent变量,探讨不同分组间的生存率差异。结果显示,rx变量的Obs组与Lev组无显著差异,而与Lev+5FU组存在显著差异;extent变量的四分类比较中也发现了一些显著的生存率差异。

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survdiff()函数可以检验两条或者多条生存曲线之间是否有差异,但这个比较的是总体间是否存在差异,不能比较生存曲线之间两两是否存在差异。

在R中使用survminer包的pairwise_survdiff()函数用来进行生存曲线之间的多重比较。

pairwise_survdiff(formula, data, p.adjust.method = "BH", na.action,
                  rho = 0)
formula:与其他生存模型一样的表达式,表示为Surv(time, status) ~ predictors。
data:数据框,公式中变量的来源。

p.adjust.method:调整p值的方法(参阅p.adjust)。
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