R语言 R包：mFD 计算与分析功能多样性的一站式综合性

功能多样性（functional diversity，FD）是指有机体与生物或非生物环境互作的属性特征的多样性。在过去的二十多年中，FD在生态学、生物地理学以及保护研究中的使用越来越多。FD的内涵是非常丰富的，但是目前尚未有统一的一个工具可以实现对FD不同指数与内容的综合分析。本文构建了名为mFD（multifaceted functional diversity）的R包，可以基于物种集合矩阵和物种性状矩阵为输入，来计算绝大多数的FD指数。

mFD首先可以用于对性状和物种集合数据进行汇总。其次，mFD可以计算物种对之间的性状距离，以帮助用户确认是否需要将物种聚类成功能实体，进而计算多维度的功能空间。为了帮助用户选择最合适的功能空间以用于计算多维度的功能多样性，mFD提供了两个函数来评估每个功能空间的质量。

第三，mFD提供了6个核心函数用于计算16个FD指数，可以是基于性状距离、功能实体或者物种位置。mFD同时提供了基于ggplot的绘图功能，可以通过自定义与高分辨率的绘图来展示FD指数。所有函数都有自带的内部的校正过程，可以自检自查。为了帮助更多用户使用，本文作者提供了5个step-by-step的网页教程。其中General Workflow是比较齐全的介绍。下面部分的入门级教程简介基于General Workflow（https://cran.r-project.org/web/packages/mFD/vignettes/mFD_general_workflow.html）。更多详细内容，请参考mFD使用手册，链接如下：https://cloud.r-project.org/web/packages/mFD/mFD.pdf。

mFD包内嵌的练习数据是“果篮里装水果”，共有3个数据集。第一个是每种水果的性状（相当于物种的性状），共包括了