脑影像分析软件推荐 | SUIT

目录

1.软件界面

2.工具包功能简介

3.软件安装注意事项


1.软件界面

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2.工具包功能简介

SUIT 是一个 Matlab 工具箱,专门用于分析人类小脑的成像数据。该工具箱包含人类小脑和脑干的高分辨率图谱模板,基于 20 名年轻健康个体的解剖结构。通过使用自动隔离和非线性归一化方法,可以实现比当前全脑方法更准确的主体间对齐。

SUIT提供以下分析方法:

1.根据解剖图像自动将小脑结构与大脑皮层隔离。

2.使用Dartel 算法实现小脑结构到寰张空间的准确解剖标准化。.

3.在基于Surface 的 flatmap 表示上显示功能数据,

4.使局灶性小脑病变正常化以进行病变-症状映射。

5.使用基于体素的形态测量法 (VBM) 来确定小脑变性或生长的模式,

6.使用小脑解剖学概率图谱将位置分配给不同的小脑小叶和小脑深核。

7.使用基于任务的数据和无任务连接的功能图谱集合来定义感兴趣区域.

使用 ROI驱动的标准化改善小脑深部核的正常化。

3.软件安装注意事项

suit-toolbox 需要 Matlab(版本 6.5 及更高版本)和 SPM。

1.最新版本需要 SPM12,但旧函数仍可用于向后兼容。没有计划为 matlab 中的 suit-toolbox 提供完整的独立版本。但是,使用隔离或归一化功能并不要求在 SPM 下进行分析。

2.解压缩存档并将 SUIT 文件夹放在目录中。或者,可以将工具箱保存在其他位置,并在目录中放置一个符号链接。<SPM_HOME>/toolbox/<SPM_HOME>/toolbox/

3.启动 Matlab 和 SPM12。选择 fMRI。SUIT 现在应该作为选项出现在工具箱下拉菜单下。

4.所有功能也可以通过从 matlab 提示符中调用相应的函数()来直接访问。suit_*

模板图像可在中找到。如果您愿意,请在更易于访问的位置创建这些模板的副本。<SPM_HOME>/toolbox/SUIT/templates。

参考文献

Diedrichsen, J. (2006). A spatially unbiased atlas template of the human cerebellum. Neuroimage, 33, 1, p. 127-138.

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