R：读取大的TXT文件

在做生信的时候经常要读取很大的基因表达矩阵，通常下载的时候是txt文件，文件巨大，读取就很慢。

下面比较三种方法的读取速度：

1. read.table

s <- Sys.time()
temp <- read.table(file = 'D:/symbol.txt', sep = '\t', header <- T, check.names = F)
e <- Sys.time()
print(e - s)
#Time difference of 2.053548 mins

D盘是我的一个老优盘，这里用了2分多钟，已经觉得有点难受了

2. ff: read.table.ffdf

library(ff)
s = Sys.time()
temp2 <- read.table.ffdf(file = 'D:/symbol.txt'