结构方程模型(Sructural Equation Modeling,SEM)是分析系统内变量间的相互关系的利器,可通过图形化方式清晰展示系统中多变量因果关系网,具有强大的数据分析功能和广泛的适用性,是近年来生态、进化、环境、地学、医学、社会、经济等众多领域应用十分广泛的统计方法。在R语言结构方程程序包中,lavaan具有简洁的语法结构、成熟模型构建和调整过程和稳定可靠的结果等特点,使其不亚于收费商业软件,是最受欢迎的结构方程模型程序包之一。
基于R语言lavaan程序包,通过理论和案例,系统介绍结构方程模型的建立、拟合、评估、筛选和结果展示的全过程。通过大量经典案例,这些案例来自Nature、Ecology、Ecological Applications、Journal of Ecology、Oikos及Ecography等主流期刊,具有很大的参考和借鉴价值。内容包括R语言入门、结构方程模型原理简介、lavaan包简介及应用案例、潜变量分析、复合变量分析、非线性/非正态/缺失数据、分类变量、分组数据、嵌套/分层/多水平数据、重复测量和时间数据、空间数据及非递归模型。
专题一、R/Rstudio简介及入门
(1)R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等
(2)R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等
(3)R语言数据文件读取、整理(清洗)、结果存储等(含tidverse)
(4)R语言基础绘图(含ggplot):基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储