R语言计算多变量两两之间的相关关系及显著性

最新推荐文章于 2023-03-25 13:00:32 发布
最新推荐文章于 2023-03-25 13:00:32 发布
阅读量7.3k 收藏 24
点赞数 1
分类专栏： R语言 统计学算法与技术 统计图表制作
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.csdn.net/ScapeD/article/details/115513345
版权

当数据存储为data.frame格式时，我们通常先将其转为matrix格式，且数据为numeric类型，继而可以使用 PerformanceAnalytics 包之间求相关，并将结果可视化。

dda <- as.matrix(d.ttreeringsClear)
dda <- apply(dda, 2, as.numeric)
chart.Correlation(dda, histogram=TRUE, pch=19)

其结果如下图所示：

 

niewzh
关注
  • 1
    点赞
  • 踩
  • 24
    收藏
    觉得还不错? 一键收藏
  • 1
    评论
专栏目录
R多变量相关性分析及相关性可视化
data+scenario+science+insight
07-18 4672
R多变量相关性分析及相关性可视化 目录 R多变量相关性分析及相关性可视化 多变量相关性计算 所有变量之间的相关性 计算数值变量的相关性 相关系数可视化 量化两个变量之间关系的一种方法是使用皮尔逊相关系数（Pearson correlation coefficient），皮尔逊相关系数（Pearson correlation coefficient）是两个变量之间线性关联程度的的一种度量。它的取值始终在-1和1之间，其中： -1表示两个变量之间完全负线性相关 0表示两个变量之间.
统计计算-随机模拟法（R语言）
08-01
文档内有例子和代码以及运行结果。 用随机模拟方法计算定积分，分别用随机投点法、平均值法、重要抽样法和分层抽样法计算。
R 计算变量之间的相关性
neweastsun的专栏
01-03 9338
本文介绍相关性，以及如何在R中计算多个变量之间的相关性。 相关性 相关性是统计学中术语，它使用协方差法来衡量向量之间的相关性程度。 数学上公式为： x 表示数据向量x y 表示数据向量y x 拔 表示x的均值 y 拔 表示y的均值 R 中使用cor函数计算相关性。语法如下： cor(x, y, method) x 和 y 表示数据向量，method 指定计算相关性的方法，默认为 pearson。 皮尔逊相关系数是量化两个变量之间的相关性，即两个变量的线性关系，其值在-1到1之间： -1 表示两个.
R语言相关性
01-07
R语言相关性 相关系数可以用来描述定量变量之间的关系。相关系数的符号（±）表明关系的方向（正相 关或负相关），其值的大小表示关系的强弱程度（完全不相关时为0，完全相关时为1）。 1、相关的类型 1、Pearson、Spearman和Kendall相关 Pearson积差相关系数衡量了两个定量变量之间的线性相关程度。 Spearman等级相关系数则衡量分级定序变量之间的相关程度。 Kendall’s Tau相关系数也是一种非参数的等级相关度量。 cor()函数可以计算这三种相关系数，而cov()函数可以用于计算协方差，两个函数的参数有 很多，其中与相关系数的计算有关的参数可以简化为：cor(x,
R语言-差异显著性分析
weixin_44231554的博客
03-25 3236
r语言差异显著性分析
R语言笔记十一：相关性分析函数及相关性检验函数
weixin_44384631的博客
07-28 1万+
1.相关性分析        相关性分析是指对两个或多个具备相关性的变量元素进行分析，从而衡量两个变量因素的相关密切程度。相关性的元素之间需要存在一定的联系或者概率才可以进行相关性分析。简单来说就是变量之间是否有关系。        相关性可能是正相关，也可能是负相关，需要根据相关系数决定。相关系数的大小表示相关程度的强弱。 2.相关性衡量指标   
R语言中多列数据计算相关系数及其显著性
邓飞----育种数据分析之放飞自我
05-18 2万+
R语言中cor函数，只能计算相关系数，如果想要计算显著性，需要两两用cor.test进行，如果是多列数据，操作比较麻烦。这里介绍两个包，非常方便的进行多列数据的相关系数及其显著性的检验，并且给出可视化。 1. 模拟数据 这里模拟出10列数据。 > set.seed(123) > dd = as.data.frame(matrix(rnorm(1000),100,10)) > he...
R语言 数据的关系探索
matlab_python22的博客
07-31 379
上述的图画出了等高线图，箱图，小提琴图等，探索了之间存在什么关系，可以看出不同的颜色之间的相关系数是不同的，可以得到不同的数据结果。数据探索进行探索变量之间的关系图绘制，COR数据展示以及相关系数矩阵的研究，探索之间的一些关系。其中数据预处理找打缺失值，进行QQ图计算，z-sorce的变化，直方图绘制以及异常值的判断。以自己找到的wine数据集为试验基础，进行数据预处理，数据探索，数据分析的试验。可以从上图看出，质量高的某些变量的取值范围的取值大小。散布图、等级图、等高图、交互图和平行坐标。...
毕业设计MATLAB_变量选择的显著性多变量相关性.zip
最新发布
02-18
毕业设计MATLAB源码资料
R语言创建新变量方法
01-07
R语言创建新变量方法 在数据分析中，可能需要对数据进行求和、求均值等处理，并且将处理后的数据重新保存到原来的数据框中，这里提供三种可供解决的方法： 数据框$变量名 <- 表达式。若原数据框中含有该变量，则做修改，否则加入新变量。 使用attach()函数。该函数可以将数据框锁定，从而不需要每次使用都输入数据框名，只需直接输入变量名即可，取消锁定使用detach()函数即可。 使用transform() 函数。格式为`transfor(data,…) mydata<-data.frame(x1 = c(2, 2, 6, 4), x2 = c(3, 4, 2,
基于多组典型相关变量的因果关系发现算法
04-30
现有的因果关系发现算法主要基于单个观察变量本身之间的因果关系，无法适用于多组观察变量，为此提出了一种多组典型相关变量的因果关系发现算法。首先，引入多组典型相关变量建立多组典型相关变量的线性非高斯无环...
R语言将第一行作为列名
热门推荐
ScapeD的博客
01-20 2万+
colnames(ClimateData)=ClimateData[1,] 格式为： colnames(表名)=表名[1,] 将第一列作为行名 类似： rownames(表名)=表名[,1]
R语言求取DataFrame(数据帧)多行/列平均值
ScapeD的博客
01-20 2万+
在Excel 使用average先求取两格子的平均值，然后可以进一步拉两个格子求取整行/整列的平均值。 这在R语言中使用rowMeans求取多行平均值，或colMeans求取多列平均值 示例如下： #create data frame data <- data.frame(var1 = c(0, NA, 2, 2, 5), var2 = c(5, 5, 7, 8, 9), var3 = c(2, 7, 9, 9, 7)
R语言读取.csv数据报错
ScapeD的博客
04-07 1万+
示例： Error in nchar(x[is_na], type = "width") : invalid multibyte string, element 1 出现读取数据报错，很多时候由数据读取默认的编码格式 与 数据本身的编码格式不同 引起的 表格中，如果含有中文或中文符号，一般默认为 GBK 编码，而一边编程语言读取时 默认为 UTF-8 编码 此时设置 读取数据编码为 GBK 即可： 示例： read_csv('data/treeringTP.csv',locale=lo
r语言实现小波分析
ScapeD的博客
04-10 5850
实现效果 左图为原始数据，右图为小波分析加显著性检测结果 所需包：WaveletComp 一、安装并加载WaveletComp包 install.packages('WaveletComp') 加载： library('WaveletComp') 二、创造数据并执行小波分析及模拟 series.length = 6*128*24 x1 = periodic.series(start.period = 1*24, length = series.length) x2 = p..
R语言DataFrame(数据帧)数据格式改为数值
ScapeD的博客
01-20 5508
使用 as.numeric() 即可将一行数据强制更改为数值，参加数值运算。 e.g. 更改前： "2","2","2","2","2","2","2","2","2","2","2","2","2","2","2" 更改后： 2，2，2，2，2，2，2，2，2，2，2，2，2，2，2 ...
统计中的“不相关”与“线性无关”
ScapeD的博客
12-19 5104
以上思维导图，看完即可理解。下述是文字介绍。 这二者是统计新手与老手都很容易混淆的两个概念，以下辨明一下： 两变量“不相关” 不相关是指二者互相独立，没有相关关系。注如森林里每棵树的树叶个数与村子里每个村民的体重...二者显然无关 两变量“线性无关” 线性这里单指直线，线性无关是指:没有一次函数关系。如果两变量是3次方的相关关系，这里也叫线性无关。其图示如下： ‘可以看出，如果两变量不相关，则必有线性无关。反之则不一定。 ...
ggplot2 一页多图+共享图例
ScapeD的博客
08-19 4528
结果图： ggpubr包提供了方便的一页多图方法，并且提供了方便的共享图例方法。 因为应用中，一个页面上多幅单一类型的图一般只需一个图例即可。 参照以下代码： library(ggpubr) dsamp <- diamonds[sample(nrow(diamonds), 1000), ] p1 <- qplot(carat, price, data = dsamp, colour = clarity) p2 <- qplot(cut, price, data = d.
单因素方差分析计算每两组数据的显著性，R语言代码
06-09
以下是在R语言中进行单因素方差分析并计算每两组数据的显著性的代码： ``` # 读取数据 data <- read.csv("your_data.csv") # 进行单因素方差分析 fit <- aov(dependent_variable ~ independent_variable, data = data) # 计算每两组数据的显著性 pairwise <- pairwise.t.test(dependent_variable ~ independent_variable, data = data) # 输出显著性结果 print(pairwise$p.value) ``` 将上述代码中的"your_data.csv"替换为你的数据文件名，"dependent_variable"替换为因变量的列名，"independent_variable"替换为自变量的列名。这个代码将会进行单因素方差分析并计算每两组数据的显著性。最后输出的结果是一个矩阵，其中每个元素表示两组数据之间的显著性水平。如果某个元素的值小于0.05，则表示这两组数据之间存在显著差异。 需要注意的是，`pairwise.t.test()`函数默认使用两两配对的学生t检验来进行显著性检验。如果你的数据不满足t检验的假设条件，可以考虑使用其他的检验方法，例如Wilcoxon秩和检验等。

“相关推荐”对你有帮助么？

  • 非常没帮助
  • 没帮助
  • 一般
  • 有帮助
  • 非常有帮助
提交
评论 1
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值