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原创 csdn再见

去nmd的VIP可见吧

2020-10-02 10:57:21 151

原创 ubuntu下安装rosetta的记录

1 下载的时候尽量在过夜下载或者在win下下载2 ubuntu解包如果错误就重新下载3 下载pymol时出现RPC failed;curl 18 。。。就在下载命令后加–depth 14 pyrosetta安装时出现无法from distutils import 时就重新安装python3-dev5 虚拟机玩坏了卡在started user manager uid 121时,建议重装桌面系统gnm或者直接安装tty1,从此使用命令行;如果卡在了smbus,把前面那串代码禁了,一般是i2c_piix4

2020-08-26 09:43:55 2122 2

原创 简记git上传GitHub

gitbash进入目录,git init初始化一个仓库git add . 添加文件git commit -m 添加注释git remote add origin https: 连接GitHub仓库git push origin master 上传git clone https: 下载git checkout -b 创建并切换到新分支git push origin test:mast...

2019-12-28 16:36:31 268

原创 ncbi和ensembl上的序列下载

根据已有的基因ID,需要从ncbi和ensembl上下载对应序列。使用语言:python3从ncbi上下载序列的话,python有一个对应的包,好像是ncbi官方支持的,就叫biopython,省去了去ncbi里找API。但是ensembl似乎没有支持的包,所以只能通过官方的API接口,叫rest,里面提供了各式各样的接口服务。...

2019-03-02 20:40:51 4247

原创 初识cytoscape.js

(cytoscape.js是一个做网页可视化的常用工具,http://js.cytoscape.org/ 这是他的官网,里面有很多很精美很牛批的案例。但是笔者很渣,接触到这个也是因为网页的功能需求,在接触这个之前甚至都不会js。而写这个的原因是因为在弄这个的时候发现网上的这类教程不多,甚至可以用少来形容。) 首先通过官网来到cytoscape的代码库,发现里面有很多文件和文件夹,但是我们用到的...

2018-08-01 17:03:50 3747

phylip工具

构建进化树可以用DNA序列,也可以用protein序列。一、利用phylip进行蛋白序列进化树分析步骤 1. 运行Clustalw,得到protein.phy文件; 2. 运行seqboot,输入protein.phy文件,输出protein_1.outfile。R选择1000,seed number: 3,然后选择Y。将得到的protein_1.outfile改名为protein_2.infile。 3. 运行protpars,输入protein_2.infile,输出protein_2.outfile和protein_2.outtree。J选择3(seed number),5(jumple number),M值选择D,然后输入1000 (sets)。最后选择Y。将得到的protein_2.outtree改为protein_3.intree. 4. 运行consense,输入protein_3.intree,选择Y。得到protein_3.outfile和protein_3.outtree

2018-08-15

TreeView构建树工具

TreeView控件用来显示信息的分级视图,如同Windows里的资源管理器的目录。TreeView控件中的各项信息都有一个与之相关的Node对象。TreeView显示Node对象的分层目录结构,每个Node对象均由一个Label对象和其相关的位图组成。在建立TreeView控件后,我们可以展开和折叠、显示或隐藏其中的节点。TreeView控件一般用来显示文件和目录结构、文档中的类层次、索引中的层次和其他具有分层目录结构的信息。

2018-08-15

空空如也

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