CLM5或CESM2 软件/操作系统 要求

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动机

我成功再单点上运行了 CLM，并输出了结果。但是在区域上运行时，总是不出结果，所以我又来查找CESM2.*的相关User Guide，希望能够找到答案。
翻译网页的链接地址

https://escomp.github.io/CESM/versions/cesm2.2/html/introduction.html#cesm2-software-operating-system-prerequisites

简介（CESM2.2）

本指南指导新手和有经验的用户下载、构建和运行CESM2。
CESM2 用户指南的大部分内容都包含在CIME文档中。

如果您是新用户，我们建议您阅读CIME文档的前几部分，该部分编写的尽可能使各个部分独立，并且 可以扫描CIME文档指南并阅读相对广告的部分临时命令。

注意：
在本用户手册中标注为 $VAR 通常是指在CESM实例（case）XML文件中变量。在 case 目录中，可以通过./xmlquery $VAR查询变量的值。在一些情况下， $VAR 是指shell中或其他的变量，此文档尽量将这些变量表达清楚。

ESM 模型版本命名约定

CESM 模型发布版本包括由句点 "."分隔的三个数字组成，如 CESM X.Y.Z

X - 对应于指示重大科学变化的主要版本号。
Y - 对应于为目标组件添加新的基础设施和新的科学能力。
Z - 对应于发布错误修复和机器更新。

当我门提及 CESM2 版本的时候，其包括CESM2.Y.Z的所有版本。

CESM 总览

区域地球系统模型（CESM）是一种耦合了气候模型的，用于预测地球气候的系统。其由 atmosphere, ocean, land, river run-off, land-ice, and sea-ice 等模型组成，同时独立地或者相互耦合在一起，在此基础上，CESM允许研究人员对地球过去、现在和未来的气候状况进行研究。
CESM可以在许多不同的硬件平台上运行，并且在组件的处理器布局方面具有相对灵活的设计。
CESM 是一个由美国气候研究人员之间共同合作努力的项目。CESM 项目主要由美国国家科学基金会 (NSF) 支持，以科罗拉多州博尔德的国家大气研究中心 (NCAR) 为中心，与美国能源部 (DOE)和美国 国家航空航天局 (National Aeronautics and Space Administration )密切合作。CESM的科学发展由CESM工作组指导，其每年召开两次会议。主要的 CESM 研讨会于每年 6 月举行，以展示各个工作组的成果并协调工作组之间未来的 CESM 发展。该CESM网站 提供有关 CESM 项目的更多信息，例如管理结构、科学工作组、可下载的源代码以及来自先前 CESM 实验数据的在线存档。

CESM2 软件/操作系统 要求

• UNIX 内核的操作系统，例如 CNL, AIX or Linux
• python 版本大于等于2.7
• perl 5
• subversion client（版本需高于 1.8 但是要低于 v1.11) ，以用来下载 CAM, POP, and WW3
• git client，高于1.8
• Fortran compiler 编译器，需要支持 Fortran 2003
• C compiler 编译器
• MPI （即使CESM并不绝对要求它在一个处理器上运行）
• NetCDF 4.3 或者更新的版本
• pnetcdf 1.7.0 是要求的，1.8.1 版本可选，但是不建议
• LAPACK 和 BLAS
• CMake 2.8.6 或者更新
• 某些配置可能需要Trilinos
• ESMF 5.2.0 或者更新 (可选).

警告
使用CESM编译器构建NetCDF。在构建Netcdf过程中，FC（Fortran compiler）的环境变量需要指定哪个编译器要使用。CESM主要使用Fortran编写，NetCDF是通过 C 编写的。因为没有一个标准的方式通过Fortan程序取调用 C 程序，所以在 CESM 与 NetCDF 层之间的 Fortran 向 C的转化非常依赖于CESM 使用哪个Fortran编译器。当在Netcdf库中的一个函数被Fortran程序调用时，Netcdf的Fortran API就回去调用Netcdf的C库。如果你不使用相同的编译器去构建netCDF和CESM，你将会很大可能会从netCDF中 get 错误，说某个netCDF的函数找不到（certain netCDF functions cannot be found.）。

Parallel-netCDF,也被称为 pnetcdf，其也是可选的。如果用户选择了使用pnetcdf，则应该选择1.7.0或更高版本或在CESM中进行应用。pnetcdf是一个文件格式与netCDF兼容的库，并其性能要比MPI-IO更加优越。pnetcdf的调用可通过设置在Macros.make文件中$PNETCDF_PATHMakefile变量进行设置。

结语

自己翻译一遍，记忆更加深刻了；例如pnetcdf原来一直没有没有搞清楚干啥的，现在最起码说起来有些映像了。再接再厉！

相关软件包下载地址，附在这里
netCDF 4.8.0 ：https://www.unidata.ucar.edu/software/netcdf/
pnetCDF1.7.0 ： https://trac.mcs.anl.gov/projects/parallel-netcdf/
Cmake : https://cmake.org/