DSSAT模型建模方法、Python+DSSAT快速批量运行及交叉融合、扩展

Decision Support Systems for Agrotechnology Transfer (简称DSSAT)模型是世界知名的作物生长模拟模型之一。现有版本V4.7能模拟27种主要农作物的生长发育和产量形成过程,被广泛应用于精细农业、水肥管理、气候变化、粮食安全、土壤碳周转、环境影响、农业可持续性、农业生态等诸多与农业生产和科研有关的领域。DSSAT模型内核算法是基于Fortran语言开发的,软件界面是基于C++进行开发。了解和熟悉DSSAT模型的关键算法和软件的操作是学习DSSAT模型的基础。此外,想要成为一名优秀的作物模型使用者与科研团队不可或缺的人才,除了掌握对作物模型相关知识之外,还要掌握模型的快速模拟和高效数据分析能力。Python是一门应用场景广泛、简单易学的程序语言,在DSSAT模型的气候、土壤、管理措施等数据准备,自动化模拟和结果分析上都发挥着重要的作用。
实践部分从DSSAT模型算法和模型软件两个方面熟悉掌握DSSAT模型的使用。进阶部分学习如何利用Python程序语言来快速使用DSSAT模型,让大家不需要使用界面操作就可以快速批量运行DSSAT模型方便各个领域可以更好地交叉融合、扩展应用。
精选大量作物模型应用案例,全程干货,全面熟悉DSSAT这一综合型农业生态系统模型,提高模型应用能力、数据分析和图表制作技能。如果你是资深模型爱好者,这次学习可以进一步熟悉各个模块的相关算法;如果你是个模型入门者,这次学习将让你体验一键模拟的乐趣

【专家】:肖博士,一流高校老师,长期从事农业、生态领域多源数据整合,土壤-作物生长模型模拟和机器/深度学习开发、应用及空间网格模拟,发表了多篇SCI高水平论文,具有丰富的科研和教学经验。

>>> DSSAT 作 物 模 型 建 模 方 法 及 实 践 技 术 应 用


第一部分:DSSAT模型建模实践技术应用内容

专题一 DSSAT模型与高级应用
1.作物生长模型的概念
2.作物生长模型的发展现状
3.DSSAT模型的开发历程
4.DSSAT模型的模块及模拟流程
5.作物生长模型的前沿应用
作物生长模型的算法改进
作物生长模型站点尺度和栅格尺度的模拟
作物生长模型与机器学习的集成
作物生长模型与遥感、表型数据的同化

专题二 DSSAT模型安装与编译
1 DSSAT模型操作
1)DSSAT的安装
2)DSSAT模型操作界面讲解
2 DSSAT模型源码操作与编译
1)DSSAT模型源码安装
2)DSSAT源码的介绍与修改
3)DSSAT源码的编译

专题三 DSSAT气象文件准备
DSSAT自带的气象数据的准备
1)DSSAT气象文件的介绍
2)日照转辐射算法
3)DSSAT气象文件转化

专题四 DSSAT模型的物候发育模块
DSSAT生育期算法
1)DSSAT模型的生育期尺度
2)DSSAT模型的积温计算
3)DSSAT模型的生育期算法
4)DSSAT模型的生育期影响因子及算法

专题五 DSSAT土壤文件准备
1 DSSAT模型的土壤输入参数
2 DSSAT模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算
3 DSSAT模型土壤输入文件准备

专题六 DSSAT土壤水-碳-氮模块
1 DSSAT模型的土壤模块
2 DSSAT模型土壤水分模块的主要算法
3 DSSAT模型土壤养分动态过程模拟及N2O排放的模拟
1)氮素的矿化和固定过程
2)氮素的硝化作用与反硝化作用
3)土壤N2O的模拟
4)土壤磷动态与模拟
4 DSSAT模型土壤碳库模型及土壤有机碳SOC的模拟
1)土壤碳库模型的发展历程
2)土壤碳的周转模型
3)土壤CO2排放和土壤有机碳的模拟

专题七 DSSAT管理文件准备
1 DSSAT模型的农田管理措施的准备
1)DSSAT模型播期和播种密度设置
2)DSSAT模型施肥设置(化肥+有机肥)
3)DSSAT模型的灌溉设置
4)DSSAT模型秸秆还田设置
2 DSSAT模型的作物生长模拟
1)光温潜在产量的模拟
2)不同管理措施下作物生长的模拟

专题八 DSSAT作物生长模拟算法
1 DSSAT模型光合生产和物质分配算法
2 DSSAT模型产量形成算法
3 DSSAT模型养分吸收、分配和养分效应算法
4 DSSAT水分效应算法

专题九 DSSAT作物参数设置和优化
1 DSSAT模型的主要遗传参数,包括物种参数、生态型参数、品种参数
2 DSSAT软件自带的参数优化方法
3 DSSAT软件自带的参数敏感性分析方法

专题十 DSSAT模型结果分析与模型评价 
1 对DSSAT模拟的模拟结果进行分析
2 对模拟结果的进行模型评价
3 对模型的结果进行做图

专题十一 更多案例模拟与疑难解答
1 不同作物、不同情景的模拟
2 实例回顾、训练、巩固
3 答疑与讨论


第二部分进阶:基于Python语言快速批量运行DSSAT模型 及交叉融合、扩展应用技术

专题一 Python语言与数据科学
1 Python语言与数据科学
1)python语言发展脉络
2)Python语言在作物模型中的应用
2Python软件安装及入门
1)Anaconda软件安装
2)Python库的安装与基本语法
3)Python的字符操作与正则表达式
4)Python的数据清洗与存储
5)各种数据格式的读写及操作

专题二 Python准备DSSAT气象文件
1 Python操作和准备气象文件
1)DSSAT气象文件的编写分析
2)使用Python编写DSSAT气象文件
3)日照转辐射算法的编写
4)DSSAT气象文件的批量转化

专题三 Python准备DSSAT土壤文件
1 DSSAT模型的土壤模块及土壤输入参数
2 使用Python近似估算土壤输入参数
3 使用Pyhon语言操作和准备土壤输入文件
4 使用Python快速批量生产土壤文件
5 使用Python调用全球土壤数据库的数据并转化成DSSAT土壤文件

专题四 Python准备DSSAT管理文件
1 使用Python对农田管理措施(播期、密度、施肥、灌溉、有机肥、秸秆还田等)进行设置
2 使用Python进行管理文件批量准备(只需要填写excel,就能批量模拟)
 

专题五 Python准备DSSAT参数文件及批量模拟文件
1 DSSAT模型的主要遗传参数,包括物种参数、生态型参数、品种参数
2 主要的参数优化方法
3 使用Python语言进行参数文件准备
4 使用Python语言对批量模拟文件的编写

专题六 Python对模拟结果进行数据清洗、整理
1 使用Python读取DSSAT文件的模拟结果
2 对模拟结果进行数据清洗、分类和整理

专题七 Python对模拟结果进行数据分析及绘图
1 使用Python对模拟结果进行分析
2 使用Python计算模拟结果的MSE、RMSE、MAE、d-value、EF值
3 使用Python对模拟结果进行可视化(模拟结果的动态图和1:1图等)

专题八
根据科研或生产实际,提供数据,集体讨论DSSAT的高级应用方案
提供若干附加材料,包括典型论文、其它软件以及学习材料
实例回顾、训练、巩固
答疑与讨论

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DSSAT模型是一个复杂的农业生态系统模型,学习它需要一定的系统性。以下是系统学习DSSAT模型的步骤: 1. 了解DSSAT模型的基本概念和组成部分。DSSAT模型由多个模块组成,包括气象、作物、土壤、水分、管理、收获等模块。了解每个模块的功能和作用,有助于理解整个模型的运作原理。 2. 学习DSSAT模型的输入数据和输出结果。DSSAT模型的输入数据包括气象、土壤、作物和管理等信息,输出结果包括作物生长和产量等指标。学习如何准备输入数据和解读输出结果,是掌握DSSAT模型的重要步骤。 3. 学习DSSAT模型的使用方法DSSAT模型有多种使用方法,包括图形用户界面、命令行界面和程序接口等。学习如何使用这些工具,可以更方便地进行模拟和分析。 4. 进行DSSAT模型的实际应用。DSSAT模型可以用于研究不同作物、土壤和管理方案的生长和产量情况,也可以用于预测气候变化对农业生产的影响。进行实际应用可以帮助理解模型的实际应用价值和局限性。 5. 学习DSSAT模型扩展和改进。DSSAT模型是一个开放源代码模型,可以进行扩展和改进。了解如何进行模型扩展和改进,可以进一步提高模型的适用性和精度。 总之,系统学习DSSAT模型需要掌握基本概念、输入输出、使用方法、实际应用和扩展改进等方面的知识。可以通过学习相关文献、参加培训课程和实践操作等方式进行学习。

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