HDU 1560 DNA sequence(BFS+hash)

4 篇文章 0 订阅

题目链接:【HDU 1560】

输入n个字符串,找出最短的序列(从前往后,这n个字符串均能在这个序列中找到,不要求连续)

枚举第i个位置的可能性,一共四个字母“ACGT”,我一开始直接记录前i个字符,结果MLE了

用哈希优化,has用来记录枚举到第i个位置时,所有的字符串已经匹配掉后得到的哈希值,v[]用来记录目前已经有多少个字母已经匹配掉了

看题目中的数据,ACGT、ATGC、CGTT、CAGT,假设枚举到第3个位置,得到的字符串是ATC,那么v[1]=2,v[2]=2,v[3]=1,v[4]=1,has就是2211这四个数字的哈希值

有一个时间上的小优化,不要清零,用代码中的cas来取代memset

#include <iostream>
#include <algorithm>
#include <cstdio>
#include <cstring>
#include <string>
#include <queue>
using namespace std;
const int inf=1e7;
int cas, t, n, maks, size;
int vis[inf], len[10];
char f[5]="ACGT", str[10][10];
int v[10], has;
struct node
{
	int has, l;
}g, h;
int bfs()
{
	queue<node>q;
	g.has=0, g.l=0;
	q.push(g);
	vis[0]=cas;
	while(!q.empty())
	{
		g = q.front(), q.pop();
		has = g.has;
		for(int i=0; i<n; i++)
		{
			v[i] = has%maks;
			has/=maks;
		}
		for(int i=0; i<4; i++)
		{
			has=0;
			for(int j=n-1; j>=0; j--)
			{
				has = has*maks+v[j]+(str[j][v[j]]==f[i]);
			}
			if(vis[has]==cas) continue;
			if(has==size) return g.l+1;
			vis[has] = cas;
			h.has=has, h.l=g.l+1;
			q.push(h);
		}
	}
	return -1;
}
int main()
{
	scanf("%d", &t);
	cas=1;
	while(t--)
	{
		maks = -1;
		scanf("%d", &n);
		for(int i=0; i<n; i++)
		{
			scanf("%s", str[i]);
			len[i] = strlen(str[i]);
			maks=max(maks, len[i]);
		}
		maks++, size=0;
		for(int i=n-1; i>=0; i--) size = size*maks+len[i];
		printf("%d\n", bfs());
		cas++;
	}
	return 0;
}



评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值