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RSS订阅转载 如何在Windows 10 April 2018更新中访问XPS Viewer
https://www.happysir.com/189转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/11091051.html
2019-06-26 17:08:00
235
转载 TCGA学习篇——数据下载
下载TCGA的方法比较多，这里采用GDC下载数据。步骤一：进入官网：https://portal.gdc.cancer.gov/ 步骤二：点击Repository 第三步：点击Files或Case Case主要包括：Primary site（肿瘤起始位置，原位癌）、Program（数据来源）、Project（）、Disease Type（疾病类型）、...
2019-04-25 18:19:00
1972
转载 如何使用NCBI查找已知基因的相关信息
原文来源链接：http://www.dxy.cn/bbs/topic/25111987转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/10411084.html
2019-02-21 10:59:00
2785
转载 linux 查看文件大小（转）
原文链接： https://www.cnblogs.com/lixuwu/p/5944062.ht转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/10256075.html
2019-01-11 16:59:00
122
转载 引物设计重复性查看
1、进入UCSC官网： http://genome.ucsc.edu/index.html2、点击上方Tools下面的In-Silico-PCR链接如下： http://genome.ucsc.edu/cgi-bin/hgPcr?hgsid=705986309_JKN2cEbg5ZDs9x1oBFA2CzE2bQid3、在Forward Primer 和 Revers...
2019-01-08 16:20:00
406
转载 NCBI获取指定区域基因序列及其引物设计
获取指定基因区间序列链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_000017.11步骤一：进入NCBI主页，左边框中选择Nucleotide，并且在右边框中输入相应的搜索信息，点击Search，如下图所示： https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ 步骤二：出现如下图，点击第一个搜索结果...
2019-01-08 15:07:00
2286
转载 视频录制软件——Bandicam使用介绍
原文链接： http://www.cncrk.com/downinfo/28291.html此原文写的很好，并且操作也都很简单我就不在这里赘述了！转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/10012295.html...
2018-11-24 15:36:00
192
转载 SX知识学习——IGV
IGV下载 http://software.broadinstitute.org/software/igv/download 注：根据自己需求下载相应版本IGV使用 需要提前安装好java8 网址：https://java.com/zh_CN/download/win10.jsp—>解压IGV_Win_2.4.14，点击进入文件，进到lib文件里...
2018-09-04 17:15:00
116
转载 常用网站总结
肿瘤研究领域最常用的数据库资源 1、COSMIC： https://cancer.sanger.ac.uk/cosmic/browse/tissue?hn=carcinoma&in=t&sn=thyroid&ss=all 主要记录与人类各种类型癌症相关的体细胞突变信息，这个数据库对于突变位点的信息记 录较为详细，包括文献出处...
2018-08-03 15:30:00
223
转载 计算机知识学习——window上配置perl环境（转）
还是那句话，对于生科出生的我来说，在window上配置一个perl环境还是蛮困难的，各种解释器、编译和调试等各种安装，找了好久的资料，觉得下面链接内容对我还是比较有用，所以特此收藏分享给大家eclipse + Active perl： 原文链接：https://jingyan.baidu.com/article/9f7e7ec0e209916f2915547a.html...
2018-06-12 16:13:00
86
转载 计算机知识学习——window10台式电脑显示未插入扬声器或耳机解决方案
生物出身的我对于计算机可谓一窍不通啊，当某天自己window10台式电脑声音出现问题，自己在那里瞎折腾了半天，看着网上的各种教程一个一个的试，终于解决了。为了避免以后出现类似问题，特此记录以防万一，快速解决！我的声音出现问题如下所示：1、左键点击控制面板2、左键点击硬件和声音3、左键点击Realtek高清晰音频管理4、点击右下角设置图标5...
2018-05-21 15:49:00
2023
转载 SX知识学习——sources
1、博客及公众号：http://www.biotrainee.com/forum-118-1.html2、Bioinformatics data skill：https://www.safaribooksonline.com/library/view/bioinformatics-data-skills/9781449367480/?utm_medium=referral&...
2018-04-03 15:30:00
139
转载 SX知识学习——TCGA（转）
https://github.com/BioinformaticsFMRP/TCGAbiolinks#tcgabiolinks---an-rbioconductor-package-for-integrative-analysis-with-tcga-data http://bioinformaticsfmrp.github.io/TCGAbiolinks/ https:...
2018-03-25 14:58:00
107
转载 SX知识学习——WES（转）
https://github.com/jmzeng1314/NGS-pipeline/tree/master/WES转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/8644284.html
2018-03-25 13:47:00
121
转载 SX知识学习——CHIPseq（转+总结）
http://www.htslib.org/workflow/#mapping_to_variant分析流程：step0—安装相关软件step1—下载参考基因组数据和分析数据以及原始测序数据sra格式转换为fastq格式sratoolkit ：https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=softwaresr...
2018-03-25 09:34:00
337
转载 编译软件安装——VS2010
1、百度：https://jingyan.baidu.com/article/ab0b5630821ca7c15afa7dee.html2、博客园：https://blog.csdn.net/weixin_39381833/article/details/78078343?locationNum=4&fps=1转载于:https://www.cnblogs.com/fan...
2018-03-23 10:04:00
79
转载 数据库知识学习——mysql
第一部分 mysql的安装第一步：下载安装 网址：https://dev.mysql.com/downloads/mysql/5.5.html#downloads 演示如下： （1） （2） ...
2018-03-20 15:15:00
74
转载 计算机知识学习——计算机组成原理
学习资源：http://blog.csdn.net/zhangyuan19880606/article/details/51258759作者：Cascade链接：https://www.zhihu.com/question/20706264/answer/17004815来源：知乎著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。这门课绝对算是我四年里...
2018-03-12 16:31:00
84
转载 window 10 配置Java环境变量
http://cellprofiler.org/manuals/current/博客：http://blog.csdn.net/fkjslee/article/details/51837848第一步：下载软件： Java：http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.ht...
2018-02-26 14:32:00
74
转载 linux知识学习——Linux编码风格（转）
1、https://wenku.baidu.com/view/29009a84bceb19e8b8f6badc.html2、http://blog.csdn.net/stuartguo/article/details/52065642Chinese translated version of Documentation/CodingStyleIf you have an...
2018-02-25 13:17:00
99
转载 SX知识学习——NGS（GATK）（转生信菜鸟团）
http://www.bio-info-trainee.com/838.htmlGATK官网：https://software.broadinstitute.org/gatk/documentation/quickstarthttp://annovar.openbioinformatics.org/en/latest/user-guide/download/GATK分析博客...
2017-12-27 09:43:00
257
转载 linul里安装Java（转）
http://www.linuxdiyf.com/linux/22044.html转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/8109047.html
2017-12-25 13:55:00
71
转载 lrzsz安装
下载：wget ftp://ftp.linux4sam.com/pub/ptxdist/ptx_sources/lrzsz-0.12.20.tar.gz编译及安装经验：https://jingyan.baidu.com/article/eb9f7b6d78c6b7869264e864.htmlhttps://wenku.baidu.com/view/efec68cc5fb...
2017-12-14 17:11:00
106
转载 生信数据分析—cmake
1、进入自己目录：cd /home/liuwenfang/biosoft2、在biosoft目录系建软件存放目录：mkdir cmake3、下载cmake：https://cmake.org/download/https://cmake.org/files/v3.10/cmake-3.10.0.tar.gz（下载网站）4、解压：tar -zxvfcmak...
2017-11-30 12:16:00
176
转载 生信数据分析—bamtools
相关网站http://www.biotrainee.com:8080/thread-764-1-1.htmlhttps://github.com/pezmaster31/bamtools/wiki/Building-and-installing（下载网站）转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/7928009.html...
2017-11-30 11:09:00
519
转载 生信数据分析—Sam格式
http://www.biotrainee.com:8080/thread-763-1-6.htmlhttps://samtools.github.io/hts-specs/SAMv1.pdf转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/7927738.html
2017-11-30 10:22:00
232
转载 生信数据分析—序列比对软件（转）
https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_sequence_alignment_software转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/7927628.html
2017-11-30 09:58:00
300
转载 GRCh38参考数据分析流程（转）
http://blog.csdn.net/xubo245/article/details/50858334（CSDN转）转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/7921721.html
2017-11-29 17:26:00
1785
转载 常用文件解压命令
1、tar.gz格式解压：如liuwenfang.tar.gz解压命令：tar -zxvf liuwenfang.tar.gz2、.zip格式解压如liuwenfang.zip解压命令：unzipliuwenfang.zip3、fna.gz格式解压如liuwenfang.fna.gz解压命令：gzip -d liuwenfang.fna.gz转...
2017-11-29 17:04:00
1806
转载 生信数据下载（转）
需要了解的知识点：测序仪原理一、数据下载生物信息学常见的数据下载，包括基因组，gtf，bed，注释http://www.biotrainee.com/thread-857-1-1.html各版本对应关系：http://www.bio-info-trainee.com/1469.html（生信技能树）测试数据及参考基因组准备：http://www.biotr...
2017-11-29 15:23:00
818
转载 Circos安装 (转+总结)
第一步：下载perl和Circos安装包这里选择的是ActiveState Perl for Windows，因为其配备了可视化的perl模块管理器ppm，极大的方便了初学者管理和安装perl关联模块，完全点击式鼠标操作。http://www.perl.org/get.htmlhttp://circos.ca/software/download/circos/（下载软件网站...
2017-11-28 13:49:00
426
转载 ggplot2—Pathway富集分析气泡图
一、作图数据下载（KEGG） http://www.oebiotech.com/Article/smkeggsjnj.html http://blog.sina.com.cn/s/blog_02af82b00102w8xz.html http://www.bioon.com.cn/news/showarticle.asp?newid=...
2017-11-24 15:08:00
3280
转载 ggplot2绘图
基本语法：geom_XXXx(参数）——见R语言实战 p407-408几何函数常见选项（参数）color：对点、线、填充区域的边界进行着色fill：对填充区域着色alpha：颜色的透明度linetype：图案的线条 （从0（完全透明）到1（不透明））size：点的尺寸和线的宽度shape：点的形状position：绘制条形图或点等对象的位置...
2017-11-21 12:32:00
224
转载 linux常用命令小结
https://www.cnblogs.com/laov/p/3541414.html#Linux转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/7833635.html
2017-11-14 17:26:00
62
转载 生信学习网站
Perl：http://perldoc.perl.org/perl.htmlhttp://www.perlmonks.org/https://qntm.org/files/perl/perl.html生信分析网站（软件）https://omictools.com/转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/7827179...
2017-11-13 17:15:00
419
转载 Perl学习建议（转）
首先要理解perl里面的三种变量表示方式:$ 表示单个变量 用单双引号区别，q(),qq()@ 表示多个变量组成的数组，qw()% 表示关系型变量-hash变量不严格区分类型，没有int/float/double/char这样的概念以及对这些简单变量的操作函数# Numerical operators: <, >, <=, >=...
2017-11-13 11:18:00
149
转载 R作图函数（转）
dev.new()新建画板plot()绘制点线图,条形图,散点图.barplot()绘制条形图dotchart()绘制点图pie()绘制饼图.pair()绘制散点图阵boxplot()绘制箱线图hist()绘制直方图scatterplot3D()绘制3D散点图.低级绘图函数:par() 可以添加很多参数来修改图形title(...
2017-11-13 11:15:00
109
转载 Shell编程（视屏总结）
一、基础正则表达式 1、正则表达式 正则表达式：用来在文件中匹配符合条件的字符串，正则是包含匹配，grep、awk、sed等命令支持正则表达式，语法：grep ["选项"] 文件名 如grep “*” student.txt 提取行 选项含义：“[]” 匹配中括号内任意字符串...
2017-11-09 09:36:00
52
转载 linux命令中英文对照（转）
www.bio-info-trainee.com/2821.html转载于:https://www.cnblogs.com/fangfang66/p/7803800.html
2017-11-08 14:12:00
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