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转载 生物信息学--研究方向
生物信息学利用应用数学、信息学、统计学和计算机科学的方法研究生物学的问题。目前的生物信息学基本上只是分子生物学与信息技术(尤其是因特网技术)的结合体。生物信息学的研究材料和结果就是各种各样的生物学数据,其研究工具是计算机,研究方法包括对生物学数据的搜索(收集和筛选)、处理(编辑、整理、管理和显示)及利用(计算、模拟)。目前主要的研究方向有:序列比对,基因识别,基因重组,蛋白质结构预测,基...
2014-01-30 21:34:00
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转载 linux sed命令详解
1. Sed简介sed 是一种在线编辑器,它一次处理一行内容。处理时,把当前处理的行存储在临时缓冲区中,称为“模式空间”(pattern space),接着用sed命令处理缓冲区中的内容,处理完成后,把缓冲区的内容送往屏幕。接着处理下一行,这样不断重复,直到文件末尾。文件内容并没有 改变,除非你使用重定向存储输出。Sed主要用来自动编辑一个或多个文件;简化对文件的反复操作;编写转换程序等...
2014-01-02 22:06:00
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转载 shell编程基础
为什么要进行shell编程 Linux系统中虽然有各种各样的图形界面工具,但shell仍然是一个非常灵活的工具。Shell不仅集合了大量命令,还是一门非常棒的编程语言。借助shell,大量任务能实现自动化;shell特别擅长系统管理任务,尤其适合那些易用性、可维护性和便携性比效率更重要的任务。 下面,让我们一起来看看shell是如何工作的:建立一个脚本 Linux中有许多种...
2013-12-30 12:22:00
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转载 得分矩阵PAM与BLOSUM的比较与区别
对于蛋白质序列,计分矩阵主要用于记录在做序列比对时两个相对应的残基的相似度,一旦这个矩阵定义好了以后,比对程式就可以利用这个矩阵,尽量将相似的残基排在一起,以达到最好的比对。 得分矩阵主要有两种,第一种就是PAM(Point Accepted Multation),另一种就是BLOSUM。1、PAM矩阵(Point Accepted Mutation) 基于进化的点突变模型,如果...
2013-12-29 18:44:00
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空空如也
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