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原创 生信分析—差异分析,聚类分析,相关性分析
生信中提到的二代数据通常指的是第二代测序数据,即在基因组学研究中使用的第二代高通量测序技术生成的数据。第二代测序技术包括Illumina/Solexa、454/Roche、Ion Torrent等平台,它们通常以高通量、低成本、高准确性和较短的读长为特点。这些技术的出现使得大规模基因组测序成为可能,对于遗传学、演化生物学、临床医学等领域的研究起到了重要的推动作用。表型:生物个体可观测的性状。基因型:是指某一生物个体全部基因组合的总称。它反映生物体的遗传构成,即从双亲获得的全部基因的总和。
2023-11-18 15:56:39 4552 2
原创 服务器从零部署环境进行测序
加载所需的包#生成随机数据,以一个表达定量文件为基础,生成随机数列来替换其中的样本表达量这一列,从而得到多个表达定量文件用于后边合成表达谱# 循环20次# 读取原始数据表# 将第七列替换为随机数列# 导出新表write.csv(original_data, paste0("新表_", i, ".csv"), row.names = FALSE)#将生成的随机数据读入,合成表达谱# 获取当前文件夹下所有的CSV文件# 创建一个空的数据框用于存储合并后的结果。
2023-10-02 14:11:39 308 1
原创 Java—09—面向对象
Java方法是一组指令的集合,用于执行特定的任务。它们是在类中定义的,并且可以从其他类中使用。在Java中,方法被定义为类中的一个代码块,用于执行特定功能。下面是Java方法的定义:访问修饰符 返回类型 方法名(参数列表) {// 方法体// 执行具体的任务return 返回值;其中,访问修饰符指定了该方法可以被哪些代码访问。返回类型指定了该方法返回值的数据类型。方法名是一个用于标识方法的名称。参数列表指定了传递给该方法的参数。方法体包含实际的Java代码,执行特定的任务。
2023-09-19 14:23:04 42 1
原创 Java—08—数组
数组是一种数据结构,用于存储一组相同类型的数据元素,这些数据元素按照一定的顺序排列,并且可以通过一个公共的下标来访问和操作其中的元素。数组的定义通常包含以下几个要素:数据类型:数组中存储的数据元素的类型,可以是任何合法的数据类型,比如整型、字符型、浮点型等。数组名:数组的名称,用于标识数组,可以由字母、数字和下划线组成,但必须以字母或下划线开头。数组长度:数组中存储的元素的个数,通常用非负整数表示。元素类型:数组中每个元素的数据类型,和数组的数据类型相同。
2023-09-14 17:30:29 35 1
原创 Java—07—方法
Java方法定义是指在Java程序中创建和声明方法的过程。方法定义包括方法的名称、参数列表、返回类型和方法体。访问修饰符用于控制方法的访问权限,可以是public、protected、private或默认。static关键字表示该方法是静态方法,可以在无需创建对象的情况下直接调用。final关键字表示该方法是不可重写的。返回类型指定方法的返回值类型。可以是任何Java数据类型,包括基本数据类型、对象和数组。如果方法不返回任何值,则返回类型为void。方法名是方法的唯一标识符,同时也是方法的调用标识符。
2023-09-12 16:06:33 32
原创 Java基础—06—流程控制
分别表示字符串、整数和带有两位小数的浮点数。在这些格式说明符后面,用一个逗号分隔要输出的变量列表即可。以上所有步骤都是按照顺序依次执行的。这就是顺序结构的特征。当条件为false时do while循环会多增加一次。JDK7以后支持string。在上面的示例中,我们使用了。
2023-09-10 10:57:10 33 1
原创 Java——03
Java的包机制是一种组织代码的方式,可以将相关的类和接口组织在一起,并与其他包中的代码分隔开来。包可以提供一些重要的功能,例如:命名空间管理:Java包可以为类和接口提供命名空间,防止命名冲突。访问控制:Java包可以使用访问修饰符控制类和接口的可见性。模块化:Java包可以使代码更易于维护和组织,促进模块化设计。这个包声明将包含在com.example.myproject包中的所有类和接口。包名应该按照惯例使用小写字母,多个单词之间用点号(.)隔开。Java包还可以通过类路径来加载。
2023-09-04 20:27:09 36 1
原创 python基础—05–双for循环
""":param r:打印行数:param c: 打印列数:return:"""for i in range(r): # 外层循环控制行for z in range(c): # 内层循环控制列print()sd(4,7)###定义一个一维列表的函数#例如:[1,2,3]->1 2 3list01 = [###列表转置list01 = [[1,2,3,4],[5,6,7,8],
2023-09-02 15:01:33 898
原创 Python基础--03
一系列字符组成的不可变序列容器,存储的是字符的编码值下面是一些Python中常见的字符串字面值的示例:""或''或或其中,name和age是变量名,可替换为任意值。在使用f字符串格式化时,使用{}包含变量名即可插入变量值。
2023-08-29 22:04:47 44 1
空空如也
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