bug_python: rpy2_lib/libreadline.so.6: undefined symbol: PC

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1 问题

ubuntu环境,通过命令行加载`rpy2.rbojects`出错:

ImportError: /home/muscle/anaconda3/bin/../lib/libreadline.so.6: undefined symbol: PC

2 原因


conda 内置readline包没有链接到 ncurses库。

3 解决方法


cp -p /lib/x86_64-linux-gnu/libreadline.so.6 ~/anaconda/lib/libreadline.so.6
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在安装rpy2时出现distutils.errors.LinkError: command '/usr/bin/gcc' failed with exit code 1的错误,这通常是由于缺少必要的依赖项或编译器问题引起的。以下是解决此问题的一些方法: 1. 确保已安装必要的依赖项: - 确保已安装R语言环境。rpy2是一个Python与R语言之间的接口库,因此需要先安装R语言环境。可以从R官方网站(https://www.r-project.org/)下载并安装适合您操作系统的版本。 - 确保已安装Python开发包。在某些操作系统上,需要安装Python开发包才能编译和安装rpy2。例如,在Ubuntu上,可以使用以下命令安装Python开发包: ```shell sudo apt-get install python3-dev ``` 2. 检查编译器设置: - 确保已安装正确的编译器。在Mac OS上,默认的C编译器是clang,而不是gcc。如果您的系统上没有安装gcc,可以尝试安装Xcode Command Line Tools,它包含了gcc编译器。可以使用以下命令安装Xcode Command Line Tools: ```shell xcode-select --install ``` - 如果已安装gcc,可以尝试将其设置为默认编译器。可以使用以下命令将gcc设置为默认编译器: ```shell sudo ln -s /usr/bin/gcc /usr/local/bin/gcc ``` 3. 使用conda进行安装: - 如果您使用的是Anaconda或Miniconda,可以尝试使用conda进行安装。conda是一个包管理器,可以自动解决依赖关系并提供预编译的软件包。可以使用以下命令创建一个新的conda环境并安装rpy2: ```shell conda create -n myenv conda activate myenv conda install -c r rpy2 ``` 请注意,这些方法可能因操作系统和环境而异。如果上述方法仍然无法解决问题,请提供更多详细的错误信息以便进一步帮助您解决问题。

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